Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2J2Q9GZM3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2J2Q9GZM3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2J2Q9GZM3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2J2Q9GZM3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2J2Q9GZM3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2J2Q9GZM3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2J2Q9GZM3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2J2Q9GZM3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2J2Q9GZM3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2J2Q9GZM3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2J2Q9GZM3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2J2Q9GZM3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2J2Q9GZM3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2J2Q9GZM3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2J2Q9GZM3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
POLR2J2Q9GZM3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
POLR2J2Q9GZM3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
POLR2J2Q9GZM3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR2J2Q9GZM3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2J2Q9GZM3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms