Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZC3H12CQ9C0D7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZC3H12CQ9C0D7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ZC3H12CQ9C0D7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ZC3H12CQ9C0D7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZC3H12CQ9C0D7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZC3H12CQ9C0D7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZC3H12CQ9C0D7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZC3H12CQ9C0D7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZC3H12CQ9C0D7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ZC3H12CQ9C0D7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZC3H12CQ9C0D7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZC3H12CQ9C0D7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZC3H12CQ9C0D7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZC3H12CQ9C0D7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZC3H12CQ9C0D7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZC3H12CQ9C0D7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZC3H12CQ9C0D7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZC3H12CQ9C0D7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZC3H12CQ9C0D7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZC3H12CQ9C0D7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZC3H12CQ9C0D7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ZC3H12CQ9C0D7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZC3H12CQ9C0D7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZC3H12CQ9C0D7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZC3H12CQ9C0D7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZC3H12CQ9C0D7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZC3H12CQ9C0D7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZC3H12CQ9C0D7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZC3H12CQ9C0D7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZC3H12CQ9C0D7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZC3H12CQ9C0D7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZC3H12CQ9C0D7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZC3H12CQ9C0D7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZC3H12CQ9C0D7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZC3H12CQ9C0D7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZC3H12CQ9C0D7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZC3H12CQ9C0D7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZC3H12CQ9C0D7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZC3H12CQ9C0D7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZC3H12CQ9C0D7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZC3H12CQ9C0D7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZC3H12CQ9C0D7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ZC3H12CQ9C0D7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZC3H12CQ9C0D7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZC3H12CQ9C0D7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZC3H12CQ9C0D7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZC3H12CQ9C0D7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZC3H12CQ9C0D7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZC3H12CQ9C0D7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZC3H12CQ9C0D7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZC3H12CQ9C0D7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZC3H12CQ9C0D7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZC3H12CQ9C0D7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZC3H12CQ9C0D7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZC3H12CQ9C0D7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZC3H12CQ9C0D7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ZC3H12CQ9C0D7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZC3H12CQ9C0D7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZC3H12CQ9C0D7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZC3H12CQ9C0D7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZC3H12CQ9C0D7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZC3H12CQ9C0D7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZC3H12CQ9C0D7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZC3H12CQ9C0D7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZC3H12CQ9C0D7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZC3H12CQ9C0D7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZC3H12CQ9C0D7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZC3H12CQ9C0D7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZC3H12CQ9C0D7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZC3H12CQ9C0D7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZC3H12CQ9C0D7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZC3H12CQ9C0D7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZC3H12CQ9C0D7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ZC3H12CQ9C0D7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZC3H12CQ9C0D7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZC3H12CQ9C0D7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ZC3H12CQ9C0D7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ZC3H12CQ9C0D7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ZC3H12CQ9C0D7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZC3H12CQ9C0D7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZC3H12CQ9C0D7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZC3H12CQ9C0D7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZC3H12CQ9C0D7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZC3H12CQ9C0D7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZC3H12CQ9C0D7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZC3H12CQ9C0D7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZC3H12CQ9C0D7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZC3H12CQ9C0D7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZC3H12CQ9C0D7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ZC3H12CQ9C0D7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZC3H12CQ9C0D7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZC3H12CQ9C0D7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZC3H12CQ9C0D7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZC3H12CQ9C0D7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms