Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AMBRA1Q9C0C7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AMBRA1Q9C0C7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AMBRA1Q9C0C7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AMBRA1Q9C0C7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AMBRA1Q9C0C7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AMBRA1Q9C0C7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AMBRA1Q9C0C7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AMBRA1Q9C0C7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AMBRA1Q9C0C7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AMBRA1Q9C0C7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AMBRA1Q9C0C7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AMBRA1Q9C0C7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
AMBRA1Q9C0C7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AMBRA1Q9C0C7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AMBRA1Q9C0C7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AMBRA1Q9C0C7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AMBRA1Q9C0C7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AMBRA1Q9C0C7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AMBRA1Q9C0C7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AMBRA1Q9C0C7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AMBRA1Q9C0C7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AMBRA1Q9C0C7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AMBRA1Q9C0C7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AMBRA1Q9C0C7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AMBRA1Q9C0C7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AMBRA1Q9C0C7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AMBRA1Q9C0C7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AMBRA1Q9C0C7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AMBRA1Q9C0C7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AMBRA1Q9C0C7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AMBRA1Q9C0C7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AMBRA1Q9C0C7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AMBRA1Q9C0C7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AMBRA1Q9C0C7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AMBRA1Q9C0C7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AMBRA1Q9C0C7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AMBRA1Q9C0C7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AMBRA1Q9C0C7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AMBRA1Q9C0C7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AMBRA1Q9C0C7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AMBRA1Q9C0C7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AMBRA1Q9C0C7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AMBRA1Q9C0C7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155 ms