Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ROPN1BQ9BZX4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ROPN1BQ9BZX4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ROPN1BQ9BZX4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ROPN1BQ9BZX4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ROPN1BQ9BZX4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ROPN1BQ9BZX4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ROPN1BQ9BZX4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ROPN1BQ9BZX4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ROPN1BQ9BZX4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ROPN1BQ9BZX4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ROPN1BQ9BZX4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ROPN1BQ9BZX4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ROPN1BQ9BZX4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ROPN1BQ9BZX4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ROPN1BQ9BZX4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ROPN1BQ9BZX4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ROPN1BQ9BZX4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ROPN1BQ9BZX4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ROPN1BQ9BZX4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ROPN1BQ9BZX4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ROPN1BQ9BZX4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ROPN1BQ9BZX4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ROPN1BQ9BZX4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ROPN1BQ9BZX4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ROPN1BQ9BZX4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ROPN1BQ9BZX4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ROPN1BQ9BZX4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ROPN1BQ9BZX4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ROPN1BQ9BZX4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ROPN1BQ9BZX4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ROPN1BQ9BZX4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ROPN1BQ9BZX4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ROPN1BQ9BZX4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ROPN1BQ9BZX4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ROPN1BQ9BZX4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ROPN1BQ9BZX4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ROPN1BQ9BZX4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ROPN1BQ9BZX4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ROPN1BQ9BZX4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ROPN1BQ9BZX4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ROPN1BQ9BZX4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ROPN1BQ9BZX4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ROPN1BQ9BZX4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ROPN1BQ9BZX4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ROPN1BQ9BZX4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ROPN1BQ9BZX4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ROPN1BQ9BZX4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ROPN1BQ9BZX4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ROPN1BQ9BZX4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ROPN1BQ9BZX4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ROPN1BQ9BZX4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ROPN1BQ9BZX4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ROPN1BQ9BZX4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ROPN1BQ9BZX4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ROPN1BQ9BZX4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ROPN1BQ9BZX4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ROPN1BQ9BZX4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ROPN1BQ9BZX4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ROPN1BQ9BZX4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ROPN1BQ9BZX4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ROPN1BQ9BZX4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ROPN1BQ9BZX4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ROPN1BQ9BZX4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ROPN1BQ9BZX4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ROPN1BQ9BZX4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ROPN1BQ9BZX4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ROPN1BQ9BZX4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ROPN1BQ9BZX4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ROPN1BQ9BZX4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ROPN1BQ9BZX4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ROPN1BQ9BZX4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ROPN1BQ9BZX4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ROPN1BQ9BZX4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ROPN1BQ9BZX4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ROPN1BQ9BZX4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ROPN1BQ9BZX4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ROPN1BQ9BZX4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ROPN1BQ9BZX4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ROPN1BQ9BZX4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ROPN1BQ9BZX4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ROPN1BQ9BZX4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ROPN1BQ9BZX4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ROPN1BQ9BZX4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ROPN1BQ9BZX4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ROPN1BQ9BZX4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ROPN1BQ9BZX4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ROPN1BQ9BZX4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ROPN1BQ9BZX4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ROPN1BQ9BZX4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ROPN1BQ9BZX4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ROPN1BQ9BZX4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ROPN1BQ9BZX4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ROPN1BQ9BZX4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ROPN1BQ9BZX4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ROPN1BQ9BZX4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ROPN1BQ9BZX4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ROPN1BQ9BZX4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ROPN1BQ9BZX4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ROPN1BQ9BZX4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms