Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CELF4Q9BZC1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CELF4Q9BZC1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CELF4Q9BZC1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CELF4Q9BZC1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CELF4Q9BZC1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CELF4Q9BZC1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CELF4Q9BZC1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CELF4Q9BZC1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CELF4Q9BZC1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CELF4Q9BZC1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CELF4Q9BZC1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CELF4Q9BZC1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CELF4Q9BZC1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CELF4Q9BZC1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CELF4Q9BZC1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CELF4Q9BZC1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CELF4Q9BZC1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CELF4Q9BZC1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CELF4Q9BZC1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CELF4Q9BZC1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CELF4Q9BZC1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CELF4Q9BZC1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CELF4Q9BZC1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CELF4Q9BZC1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CELF4Q9BZC1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CELF4Q9BZC1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CELF4Q9BZC1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CELF4Q9BZC1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CELF4Q9BZC1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CELF4Q9BZC1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CELF4Q9BZC1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CELF4Q9BZC1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CELF4Q9BZC1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CELF4Q9BZC1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CELF4Q9BZC1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CELF4Q9BZC1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CELF4Q9BZC1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CELF4Q9BZC1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CELF4Q9BZC1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CELF4Q9BZC1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CELF4Q9BZC1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CELF4Q9BZC1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CELF4Q9BZC1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CELF4Q9BZC1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CELF4Q9BZC1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CELF4Q9BZC1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CELF4Q9BZC1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CELF4Q9BZC1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CELF4Q9BZC1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CELF4Q9BZC1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CELF4Q9BZC1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CELF4Q9BZC1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CELF4Q9BZC1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CELF4Q9BZC1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CELF4Q9BZC1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CELF4Q9BZC1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CELF4Q9BZC1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CELF4Q9BZC1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CELF4Q9BZC1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CELF4Q9BZC1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CELF4Q9BZC1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CELF4Q9BZC1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CELF4Q9BZC1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CELF4Q9BZC1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CELF4Q9BZC1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CELF4Q9BZC1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CELF4Q9BZC1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CELF4Q9BZC1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CELF4Q9BZC1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CELF4Q9BZC1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CELF4Q9BZC1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CELF4Q9BZC1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CELF4Q9BZC1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CELF4Q9BZC1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CELF4Q9BZC1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CELF4Q9BZC1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CELF4Q9BZC1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CELF4Q9BZC1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CELF4Q9BZC1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CELF4Q9BZC1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CELF4Q9BZC1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CELF4Q9BZC1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CELF4Q9BZC1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CELF4Q9BZC1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CELF4Q9BZC1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CELF4Q9BZC1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CELF4Q9BZC1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CELF4Q9BZC1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CELF4Q9BZC1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CELF4Q9BZC1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CELF4Q9BZC1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CELF4Q9BZC1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CELF4Q9BZC1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CELF4Q9BZC1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CELF4Q9BZC1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CELF4Q9BZC1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CELF4Q9BZC1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CELF4Q9BZC1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CELF4Q9BZC1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms