Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTRT3Q9BYD9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTRT3Q9BYD9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTRT3Q9BYD9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTRT3Q9BYD9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTRT3Q9BYD9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTRT3Q9BYD9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTRT3Q9BYD9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTRT3Q9BYD9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTRT3Q9BYD9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTRT3Q9BYD9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTRT3Q9BYD9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTRT3Q9BYD9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTRT3Q9BYD9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTRT3Q9BYD9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTRT3Q9BYD9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTRT3Q9BYD9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTRT3Q9BYD9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTRT3Q9BYD9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTRT3Q9BYD9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTRT3Q9BYD9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTRT3Q9BYD9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTRT3Q9BYD9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTRT3Q9BYD9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTRT3Q9BYD9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTRT3Q9BYD9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTRT3Q9BYD9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTRT3Q9BYD9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTRT3Q9BYD9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTRT3Q9BYD9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTRT3Q9BYD9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTRT3Q9BYD9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTRT3Q9BYD9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ACTRT3Q9BYD9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTRT3Q9BYD9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTRT3Q9BYD9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTRT3Q9BYD9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTRT3Q9BYD9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTRT3Q9BYD9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTRT3Q9BYD9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTRT3Q9BYD9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTRT3Q9BYD9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTRT3Q9BYD9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTRT3Q9BYD9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTRT3Q9BYD9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTRT3Q9BYD9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTRT3Q9BYD9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTRT3Q9BYD9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTRT3Q9BYD9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTRT3Q9BYD9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTRT3Q9BYD9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTRT3Q9BYD9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTRT3Q9BYD9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTRT3Q9BYD9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTRT3Q9BYD9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTRT3Q9BYD9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTRT3Q9BYD9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTRT3Q9BYD9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTRT3Q9BYD9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTRT3Q9BYD9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTRT3Q9BYD9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTRT3Q9BYD9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTRT3Q9BYD9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTRT3Q9BYD9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTRT3Q9BYD9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTRT3Q9BYD9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTRT3Q9BYD9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTRT3Q9BYD9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTRT3Q9BYD9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTRT3Q9BYD9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTRT3Q9BYD9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTRT3Q9BYD9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTRT3Q9BYD9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTRT3Q9BYD9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTRT3Q9BYD9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTRT3Q9BYD9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTRT3Q9BYD9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTRT3Q9BYD9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTRT3Q9BYD9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTRT3Q9BYD9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTRT3Q9BYD9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTRT3Q9BYD9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTRT3Q9BYD9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTRT3Q9BYD9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTRT3Q9BYD9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTRT3Q9BYD9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTRT3Q9BYD9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTRT3Q9BYD9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ACTRT3Q9BYD9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms