Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF3

CECR2, Cat eye syndrome critical region protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CECR2Q9BXF3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.55
CECR2Q9BXF3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.55
CECR2Q9BXF3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC43.44■■■■■ 4.54
CECR2Q9BXF3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
CECR2Q9BXF3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC43.43■■■■■ 4.54
CECR2Q9BXF3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
CECR2Q9BXF3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
CECR2Q9BXF3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC43.43■■■■■ 4.54
CECR2Q9BXF3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
CECR2Q9BXF3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC43.42■■■■■ 4.54
CECR2Q9BXF3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.42■■■■■ 4.54
CECR2Q9BXF3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC43.41■■■■■ 4.54
CECR2Q9BXF3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC43.41■■■■■ 4.54
CECR2Q9BXF3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
CECR2Q9BXF3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
CECR2Q9BXF3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC43.4■■■■■ 4.54
CECR2Q9BXF3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
CECR2Q9BXF3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
CECR2Q9BXF3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
CECR2Q9BXF3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC43.39■■■■■ 4.54
CECR2Q9BXF3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
CECR2Q9BXF3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
CECR2Q9BXF3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC43.38■■■■■ 4.54
CECR2Q9BXF3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC43.38■■■■■ 4.54
CECR2Q9BXF3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC43.38■■■■■ 4.54
CECR2Q9BXF3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
CECR2Q9BXF3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC43.38■■■■■ 4.53
CECR2Q9BXF3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
CECR2Q9BXF3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC43.37■■■■■ 4.53
CECR2Q9BXF3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
CECR2Q9BXF3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
CECR2Q9BXF3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC43.37■■■■■ 4.53
CECR2Q9BXF3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
CECR2Q9BXF3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC43.36■■■■■ 4.53
CECR2Q9BXF3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC43.36■■■■■ 4.53
CECR2Q9BXF3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC43.36■■■■■ 4.53
CECR2Q9BXF3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
CECR2Q9BXF3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
CECR2Q9BXF3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
CECR2Q9BXF3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC43.32■■■■■ 4.53
CECR2Q9BXF3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.32■■■■■ 4.53
CECR2Q9BXF3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC43.32■■■■■ 4.53
CECR2Q9BXF3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.52
CECR2Q9BXF3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.52
CECR2Q9BXF3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.52
CECR2Q9BXF3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC43.32■■■■■ 4.52
CECR2Q9BXF3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC43.32■■■■■ 4.52
CECR2Q9BXF3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC43.31■■■■■ 4.52
CECR2Q9BXF3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC43.31■■■■■ 4.52
CECR2Q9BXF3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
CECR2Q9BXF3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC43.3■■■■■ 4.52
CECR2Q9BXF3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
CECR2Q9BXF3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
CECR2Q9BXF3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
CECR2Q9BXF3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC43.29■■■■■ 4.52
CECR2Q9BXF3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.29■■■■■ 4.52
CECR2Q9BXF3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.29■■■■■ 4.52
CECR2Q9BXF3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
CECR2Q9BXF3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC43.28■■■■■ 4.52
CECR2Q9BXF3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
CECR2Q9BXF3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
CECR2Q9BXF3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
CECR2Q9BXF3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC43.27■■■■■ 4.52
CECR2Q9BXF3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC43.27■■■■■ 4.52
CECR2Q9BXF3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
CECR2Q9BXF3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.27■■■■■ 4.52
CECR2Q9BXF3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC43.27■■■■■ 4.52
CECR2Q9BXF3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
CECR2Q9BXF3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC43.26■■■■■ 4.52
CECR2Q9BXF3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
CECR2Q9BXF3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
CECR2Q9BXF3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC43.26■■■■■ 4.52
CECR2Q9BXF3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
CECR2Q9BXF3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC43.25■■■■■ 4.51
CECR2Q9BXF3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC43.25■■■■■ 4.51
CECR2Q9BXF3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC43.25■■■■■ 4.51
CECR2Q9BXF3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC43.25■■■■■ 4.51
CECR2Q9BXF3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC43.25■■■■■ 4.51
CECR2Q9BXF3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC43.25■■■■■ 4.51
CECR2Q9BXF3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
CECR2Q9BXF3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC43.25■■■■■ 4.51
CECR2Q9BXF3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC43.25■■■■■ 4.51
CECR2Q9BXF3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC43.25■■■■■ 4.51
CECR2Q9BXF3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.24■■■■■ 4.51
CECR2Q9BXF3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
CECR2Q9BXF3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
CECR2Q9BXF3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.23■■■■■ 4.51
CECR2Q9BXF3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC43.23■■■■■ 4.51
CECR2Q9BXF3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
CECR2Q9BXF3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
CECR2Q9BXF3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC43.22■■■■■ 4.51
CECR2Q9BXF3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC43.21■■■■■ 4.51
CECR2Q9BXF3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
CECR2Q9BXF3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
CECR2Q9BXF3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC43.2■■■■■ 4.51
CECR2Q9BXF3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC43.19■■■■■ 4.51
CECR2Q9BXF3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.51
CECR2Q9BXF3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC43.19■■■■■ 4.51
CECR2Q9BXF3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC43.19■■■■■ 4.5
CECR2Q9BXF3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC43.19■■■■■ 4.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms