Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX95

SGPP1, Sphingosine-1-phosphate phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGPP1Q9BX95 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGPP1Q9BX95 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGPP1Q9BX95 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGPP1Q9BX95 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGPP1Q9BX95 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGPP1Q9BX95 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGPP1Q9BX95 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SGPP1Q9BX95 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGPP1Q9BX95 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGPP1Q9BX95 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SGPP1Q9BX95 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGPP1Q9BX95 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGPP1Q9BX95 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGPP1Q9BX95 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGPP1Q9BX95 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGPP1Q9BX95 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGPP1Q9BX95 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGPP1Q9BX95 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGPP1Q9BX95 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGPP1Q9BX95 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGPP1Q9BX95 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGPP1Q9BX95 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGPP1Q9BX95 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGPP1Q9BX95 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGPP1Q9BX95 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGPP1Q9BX95 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGPP1Q9BX95 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGPP1Q9BX95 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGPP1Q9BX95 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGPP1Q9BX95 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGPP1Q9BX95 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGPP1Q9BX95 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGPP1Q9BX95 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGPP1Q9BX95 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SGPP1Q9BX95 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGPP1Q9BX95 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SGPP1Q9BX95 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGPP1Q9BX95 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGPP1Q9BX95 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGPP1Q9BX95 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGPP1Q9BX95 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGPP1Q9BX95 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGPP1Q9BX95 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGPP1Q9BX95 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGPP1Q9BX95 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGPP1Q9BX95 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGPP1Q9BX95 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGPP1Q9BX95 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGPP1Q9BX95 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SGPP1Q9BX95 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGPP1Q9BX95 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGPP1Q9BX95 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGPP1Q9BX95 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGPP1Q9BX95 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGPP1Q9BX95 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGPP1Q9BX95 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGPP1Q9BX95 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGPP1Q9BX95 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGPP1Q9BX95 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGPP1Q9BX95 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGPP1Q9BX95 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGPP1Q9BX95 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SGPP1Q9BX95 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGPP1Q9BX95 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGPP1Q9BX95 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGPP1Q9BX95 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGPP1Q9BX95 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGPP1Q9BX95 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGPP1Q9BX95 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGPP1Q9BX95 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGPP1Q9BX95 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGPP1Q9BX95 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SGPP1Q9BX95 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGPP1Q9BX95 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGPP1Q9BX95 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SGPP1Q9BX95 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGPP1Q9BX95 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGPP1Q9BX95 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGPP1Q9BX95 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGPP1Q9BX95 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGPP1Q9BX95 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGPP1Q9BX95 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SGPP1Q9BX95 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGPP1Q9BX95 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGPP1Q9BX95 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SGPP1Q9BX95 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGPP1Q9BX95 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGPP1Q9BX95 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SGPP1Q9BX95 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SGPP1Q9BX95 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGPP1Q9BX95 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGPP1Q9BX95 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGPP1Q9BX95 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SGPP1Q9BX95 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGPP1Q9BX95 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGPP1Q9BX95 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGPP1Q9BX95 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGPP1Q9BX95 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGPP1Q9BX95 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGPP1Q9BX95 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms