Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
SYCP2Q9BX26 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SYCP2Q9BX26 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
SYCP2Q9BX26 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
SYCP2Q9BX26 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SYCP2Q9BX26 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SYCP2Q9BX26 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
SYCP2Q9BX26 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
SYCP2Q9BX26 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SYCP2Q9BX26 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SYCP2Q9BX26 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
SYCP2Q9BX26 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
SYCP2Q9BX26 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
SYCP2Q9BX26 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
SYCP2Q9BX26 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
SYCP2Q9BX26 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
SYCP2Q9BX26 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
SYCP2Q9BX26 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
SYCP2Q9BX26 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SYCP2Q9BX26 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SYCP2Q9BX26 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SYCP2Q9BX26 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SYCP2Q9BX26 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SYCP2Q9BX26 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SYCP2Q9BX26 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SYCP2Q9BX26 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
SYCP2Q9BX26 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
SYCP2Q9BX26 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
SYCP2Q9BX26 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SYCP2Q9BX26 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
SYCP2Q9BX26 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
SYCP2Q9BX26 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
SYCP2Q9BX26 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
SYCP2Q9BX26 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
SYCP2Q9BX26 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.29
SYCP2Q9BX26 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
SYCP2Q9BX26 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
SYCP2Q9BX26 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SYCP2Q9BX26 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
SYCP2Q9BX26 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
SYCP2Q9BX26 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SYCP2Q9BX26 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SYCP2Q9BX26 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
SYCP2Q9BX26 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
SYCP2Q9BX26 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
SYCP2Q9BX26 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
SYCP2Q9BX26 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SYCP2Q9BX26 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.54■■■■□ 3.28
SYCP2Q9BX26 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SYCP2Q9BX26 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SYCP2Q9BX26 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
SYCP2Q9BX26 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SYCP2Q9BX26 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SYCP2Q9BX26 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
SYCP2Q9BX26 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SYCP2Q9BX26 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
SYCP2Q9BX26 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
SYCP2Q9BX26 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
SYCP2Q9BX26 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
SYCP2Q9BX26 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
SYCP2Q9BX26 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
SYCP2Q9BX26 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
SYCP2Q9BX26 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
SYCP2Q9BX26 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
SYCP2Q9BX26 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
SYCP2Q9BX26 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
SYCP2Q9BX26 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
SYCP2Q9BX26 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC35.51■■■■□ 3.28
SYCP2Q9BX26 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
SYCP2Q9BX26 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC35.51■■■■□ 3.27
SYCP2Q9BX26 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
SYCP2Q9BX26 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
SYCP2Q9BX26 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
SYCP2Q9BX26 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SYCP2Q9BX26 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
SYCP2Q9BX26 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SYCP2Q9BX26 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
SYCP2Q9BX26 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
SYCP2Q9BX26 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SYCP2Q9BX26 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
SYCP2Q9BX26 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
SYCP2Q9BX26 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
SYCP2Q9BX26 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
SYCP2Q9BX26 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
SYCP2Q9BX26 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
SYCP2Q9BX26 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
SYCP2Q9BX26 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
SYCP2Q9BX26 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
SYCP2Q9BX26 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
SYCP2Q9BX26 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
SYCP2Q9BX26 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
SYCP2Q9BX26 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
SYCP2Q9BX26 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
SYCP2Q9BX26 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
SYCP2Q9BX26 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
SYCP2Q9BX26 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
SYCP2Q9BX26 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
SYCP2Q9BX26 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC35.46■■■■□ 3.27
SYCP2Q9BX26 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
SYCP2Q9BX26 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms