Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FNDC11Q9BVV2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FNDC11Q9BVV2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNDC11Q9BVV2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FNDC11Q9BVV2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNDC11Q9BVV2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNDC11Q9BVV2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNDC11Q9BVV2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNDC11Q9BVV2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNDC11Q9BVV2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNDC11Q9BVV2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FNDC11Q9BVV2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FNDC11Q9BVV2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FNDC11Q9BVV2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FNDC11Q9BVV2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FNDC11Q9BVV2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FNDC11Q9BVV2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FNDC11Q9BVV2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FNDC11Q9BVV2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FNDC11Q9BVV2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
FNDC11Q9BVV2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
FNDC11Q9BVV2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FNDC11Q9BVV2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FNDC11Q9BVV2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FNDC11Q9BVV2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FNDC11Q9BVV2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FNDC11Q9BVV2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FNDC11Q9BVV2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FNDC11Q9BVV2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FNDC11Q9BVV2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FNDC11Q9BVV2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FNDC11Q9BVV2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FNDC11Q9BVV2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FNDC11Q9BVV2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FNDC11Q9BVV2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FNDC11Q9BVV2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FNDC11Q9BVV2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FNDC11Q9BVV2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FNDC11Q9BVV2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FNDC11Q9BVV2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FNDC11Q9BVV2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FNDC11Q9BVV2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FNDC11Q9BVV2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FNDC11Q9BVV2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FNDC11Q9BVV2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FNDC11Q9BVV2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FNDC11Q9BVV2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FNDC11Q9BVV2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FNDC11Q9BVV2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FNDC11Q9BVV2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FNDC11Q9BVV2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FNDC11Q9BVV2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FNDC11Q9BVV2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FNDC11Q9BVV2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FNDC11Q9BVV2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FNDC11Q9BVV2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FNDC11Q9BVV2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FNDC11Q9BVV2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FNDC11Q9BVV2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FNDC11Q9BVV2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FNDC11Q9BVV2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FNDC11Q9BVV2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FNDC11Q9BVV2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FNDC11Q9BVV2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FNDC11Q9BVV2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FNDC11Q9BVV2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FNDC11Q9BVV2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FNDC11Q9BVV2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FNDC11Q9BVV2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FNDC11Q9BVV2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FNDC11Q9BVV2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FNDC11Q9BVV2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FNDC11Q9BVV2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FNDC11Q9BVV2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FNDC11Q9BVV2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FNDC11Q9BVV2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms