Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PAGR1Q9BTK6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PAGR1Q9BTK6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PAGR1Q9BTK6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PAGR1Q9BTK6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PAGR1Q9BTK6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PAGR1Q9BTK6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PAGR1Q9BTK6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PAGR1Q9BTK6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PAGR1Q9BTK6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PAGR1Q9BTK6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PAGR1Q9BTK6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PAGR1Q9BTK6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PAGR1Q9BTK6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PAGR1Q9BTK6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PAGR1Q9BTK6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PAGR1Q9BTK6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PAGR1Q9BTK6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PAGR1Q9BTK6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PAGR1Q9BTK6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PAGR1Q9BTK6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PAGR1Q9BTK6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PAGR1Q9BTK6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PAGR1Q9BTK6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PAGR1Q9BTK6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PAGR1Q9BTK6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PAGR1Q9BTK6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PAGR1Q9BTK6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PAGR1Q9BTK6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PAGR1Q9BTK6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PAGR1Q9BTK6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PAGR1Q9BTK6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PAGR1Q9BTK6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PAGR1Q9BTK6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PAGR1Q9BTK6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PAGR1Q9BTK6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PAGR1Q9BTK6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PAGR1Q9BTK6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PAGR1Q9BTK6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PAGR1Q9BTK6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PAGR1Q9BTK6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PAGR1Q9BTK6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PAGR1Q9BTK6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PAGR1Q9BTK6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PAGR1Q9BTK6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PAGR1Q9BTK6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PAGR1Q9BTK6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PAGR1Q9BTK6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PAGR1Q9BTK6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PAGR1Q9BTK6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PAGR1Q9BTK6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PAGR1Q9BTK6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PAGR1Q9BTK6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PAGR1Q9BTK6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PAGR1Q9BTK6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PAGR1Q9BTK6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PAGR1Q9BTK6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PAGR1Q9BTK6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PAGR1Q9BTK6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PAGR1Q9BTK6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PAGR1Q9BTK6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PAGR1Q9BTK6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PAGR1Q9BTK6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PAGR1Q9BTK6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PAGR1Q9BTK6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PAGR1Q9BTK6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PAGR1Q9BTK6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PAGR1Q9BTK6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PAGR1Q9BTK6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PAGR1Q9BTK6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PAGR1Q9BTK6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PAGR1Q9BTK6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PAGR1Q9BTK6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PAGR1Q9BTK6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PAGR1Q9BTK6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PAGR1Q9BTK6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PAGR1Q9BTK6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PAGR1Q9BTK6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PAGR1Q9BTK6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PAGR1Q9BTK6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PAGR1Q9BTK6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PAGR1Q9BTK6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PAGR1Q9BTK6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PAGR1Q9BTK6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PAGR1Q9BTK6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PAGR1Q9BTK6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PAGR1Q9BTK6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PAGR1Q9BTK6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PAGR1Q9BTK6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PAGR1Q9BTK6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PAGR1Q9BTK6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PAGR1Q9BTK6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PAGR1Q9BTK6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PAGR1Q9BTK6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PAGR1Q9BTK6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PAGR1Q9BTK6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PAGR1Q9BTK6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PAGR1Q9BTK6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PAGR1Q9BTK6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PAGR1Q9BTK6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms