Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT88

SYT11, Synaptotagmin-11, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT11Q9BT88 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYT11Q9BT88 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYT11Q9BT88 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYT11Q9BT88 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYT11Q9BT88 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYT11Q9BT88 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYT11Q9BT88 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYT11Q9BT88 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYT11Q9BT88 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYT11Q9BT88 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYT11Q9BT88 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYT11Q9BT88 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYT11Q9BT88 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYT11Q9BT88 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYT11Q9BT88 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SYT11Q9BT88 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYT11Q9BT88 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYT11Q9BT88 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYT11Q9BT88 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYT11Q9BT88 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SYT11Q9BT88 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYT11Q9BT88 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYT11Q9BT88 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYT11Q9BT88 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYT11Q9BT88 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SYT11Q9BT88 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYT11Q9BT88 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYT11Q9BT88 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYT11Q9BT88 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYT11Q9BT88 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYT11Q9BT88 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYT11Q9BT88 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYT11Q9BT88 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYT11Q9BT88 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYT11Q9BT88 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYT11Q9BT88 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYT11Q9BT88 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYT11Q9BT88 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYT11Q9BT88 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYT11Q9BT88 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYT11Q9BT88 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYT11Q9BT88 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYT11Q9BT88 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYT11Q9BT88 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYT11Q9BT88 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SYT11Q9BT88 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SYT11Q9BT88 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SYT11Q9BT88 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYT11Q9BT88 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYT11Q9BT88 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYT11Q9BT88 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYT11Q9BT88 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYT11Q9BT88 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYT11Q9BT88 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYT11Q9BT88 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYT11Q9BT88 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYT11Q9BT88 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYT11Q9BT88 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYT11Q9BT88 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYT11Q9BT88 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYT11Q9BT88 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SYT11Q9BT88 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYT11Q9BT88 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYT11Q9BT88 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SYT11Q9BT88 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYT11Q9BT88 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYT11Q9BT88 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYT11Q9BT88 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYT11Q9BT88 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYT11Q9BT88 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYT11Q9BT88 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYT11Q9BT88 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYT11Q9BT88 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SYT11Q9BT88 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYT11Q9BT88 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYT11Q9BT88 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYT11Q9BT88 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYT11Q9BT88 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYT11Q9BT88 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYT11Q9BT88 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYT11Q9BT88 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYT11Q9BT88 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYT11Q9BT88 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYT11Q9BT88 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYT11Q9BT88 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYT11Q9BT88 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT11Q9BT88 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT11Q9BT88 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT11Q9BT88 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT11Q9BT88 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT11Q9BT88 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT11Q9BT88 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT11Q9BT88 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT11Q9BT88 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYT11Q9BT88 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SYT11Q9BT88 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYT11Q9BT88 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYT11Q9BT88 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYT11Q9BT88 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYT11Q9BT88 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms