Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
C2orf88Q9BSF0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms