Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR11

ZSWIM1, Zinc finger SWIM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM1Q9BR11 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZSWIM1Q9BR11 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZSWIM1Q9BR11 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZSWIM1Q9BR11 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZSWIM1Q9BR11 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZSWIM1Q9BR11 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZSWIM1Q9BR11 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZSWIM1Q9BR11 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZSWIM1Q9BR11 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ZSWIM1Q9BR11 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZSWIM1Q9BR11 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ZSWIM1Q9BR11 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZSWIM1Q9BR11 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZSWIM1Q9BR11 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZSWIM1Q9BR11 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZSWIM1Q9BR11 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZSWIM1Q9BR11 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ZSWIM1Q9BR11 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ZSWIM1Q9BR11 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZSWIM1Q9BR11 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZSWIM1Q9BR11 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZSWIM1Q9BR11 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZSWIM1Q9BR11 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZSWIM1Q9BR11 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZSWIM1Q9BR11 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZSWIM1Q9BR11 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZSWIM1Q9BR11 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZSWIM1Q9BR11 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZSWIM1Q9BR11 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZSWIM1Q9BR11 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZSWIM1Q9BR11 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZSWIM1Q9BR11 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZSWIM1Q9BR11 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ZSWIM1Q9BR11 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZSWIM1Q9BR11 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZSWIM1Q9BR11 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZSWIM1Q9BR11 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZSWIM1Q9BR11 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZSWIM1Q9BR11 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZSWIM1Q9BR11 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZSWIM1Q9BR11 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZSWIM1Q9BR11 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZSWIM1Q9BR11 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZSWIM1Q9BR11 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZSWIM1Q9BR11 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZSWIM1Q9BR11 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZSWIM1Q9BR11 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZSWIM1Q9BR11 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZSWIM1Q9BR11 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZSWIM1Q9BR11 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZSWIM1Q9BR11 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZSWIM1Q9BR11 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZSWIM1Q9BR11 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZSWIM1Q9BR11 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZSWIM1Q9BR11 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZSWIM1Q9BR11 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZSWIM1Q9BR11 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZSWIM1Q9BR11 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZSWIM1Q9BR11 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZSWIM1Q9BR11 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZSWIM1Q9BR11 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZSWIM1Q9BR11 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZSWIM1Q9BR11 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZSWIM1Q9BR11 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZSWIM1Q9BR11 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZSWIM1Q9BR11 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZSWIM1Q9BR11 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZSWIM1Q9BR11 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ZSWIM1Q9BR11 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZSWIM1Q9BR11 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZSWIM1Q9BR11 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZSWIM1Q9BR11 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZSWIM1Q9BR11 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZSWIM1Q9BR11 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZSWIM1Q9BR11 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZSWIM1Q9BR11 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZSWIM1Q9BR11 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZSWIM1Q9BR11 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZSWIM1Q9BR11 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ZSWIM1Q9BR11 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZSWIM1Q9BR11 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZSWIM1Q9BR11 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZSWIM1Q9BR11 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZSWIM1Q9BR11 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZSWIM1Q9BR11 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZSWIM1Q9BR11 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZSWIM1Q9BR11 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZSWIM1Q9BR11 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZSWIM1Q9BR11 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZSWIM1Q9BR11 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZSWIM1Q9BR11 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZSWIM1Q9BR11 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZSWIM1Q9BR11 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZSWIM1Q9BR11 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ZSWIM1Q9BR11 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZSWIM1Q9BR11 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZSWIM1Q9BR11 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ZSWIM1Q9BR11 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZSWIM1Q9BR11 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZSWIM1Q9BR11 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms