Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TREX2Q9BQ50 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TREX2Q9BQ50 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TREX2Q9BQ50 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TREX2Q9BQ50 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TREX2Q9BQ50 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TREX2Q9BQ50 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TREX2Q9BQ50 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TREX2Q9BQ50 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TREX2Q9BQ50 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TREX2Q9BQ50 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TREX2Q9BQ50 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TREX2Q9BQ50 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TREX2Q9BQ50 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TREX2Q9BQ50 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TREX2Q9BQ50 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TREX2Q9BQ50 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TREX2Q9BQ50 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TREX2Q9BQ50 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TREX2Q9BQ50 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TREX2Q9BQ50 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TREX2Q9BQ50 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms