Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOPXQ9BPY8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOPXQ9BPY8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOPXQ9BPY8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOPXQ9BPY8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOPXQ9BPY8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOPXQ9BPY8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOPXQ9BPY8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOPXQ9BPY8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOPXQ9BPY8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOPXQ9BPY8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOPXQ9BPY8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOPXQ9BPY8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOPXQ9BPY8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOPXQ9BPY8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOPXQ9BPY8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOPXQ9BPY8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOPXQ9BPY8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOPXQ9BPY8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOPXQ9BPY8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOPXQ9BPY8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOPXQ9BPY8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOPXQ9BPY8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOPXQ9BPY8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOPXQ9BPY8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOPXQ9BPY8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
HOPXQ9BPY8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOPXQ9BPY8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOPXQ9BPY8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOPXQ9BPY8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOPXQ9BPY8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOPXQ9BPY8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOPXQ9BPY8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOPXQ9BPY8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOPXQ9BPY8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOPXQ9BPY8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HOPXQ9BPY8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOPXQ9BPY8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOPXQ9BPY8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOPXQ9BPY8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOPXQ9BPY8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms