Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CITED1Q99966 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CITED1Q99966 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CITED1Q99966 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CITED1Q99966 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CITED1Q99966 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CITED1Q99966 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CITED1Q99966 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CITED1Q99966 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CITED1Q99966 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CITED1Q99966 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CITED1Q99966 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CITED1Q99966 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CITED1Q99966 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CITED1Q99966 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CITED1Q99966 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CITED1Q99966 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CITED1Q99966 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CITED1Q99966 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CITED1Q99966 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CITED1Q99966 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CITED1Q99966 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CITED1Q99966 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CITED1Q99966 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CITED1Q99966 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CITED1Q99966 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CITED1Q99966 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CITED1Q99966 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CITED1Q99966 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CITED1Q99966 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CITED1Q99966 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CITED1Q99966 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CITED1Q99966 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CITED1Q99966 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CITED1Q99966 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CITED1Q99966 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CITED1Q99966 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CITED1Q99966 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CITED1Q99966 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CITED1Q99966 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CITED1Q99966 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CITED1Q99966 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CITED1Q99966 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CITED1Q99966 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CITED1Q99966 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CITED1Q99966 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CITED1Q99966 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CITED1Q99966 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CITED1Q99966 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CITED1Q99966 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms