Protein–RNA interactions for Protein: Q99895

CTRC, Chymotrypsin-C, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRCQ99895 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTRCQ99895 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTRCQ99895 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTRCQ99895 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTRCQ99895 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTRCQ99895 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTRCQ99895 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTRCQ99895 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTRCQ99895 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTRCQ99895 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CTRCQ99895 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTRCQ99895 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTRCQ99895 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTRCQ99895 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTRCQ99895 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTRCQ99895 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTRCQ99895 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTRCQ99895 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTRCQ99895 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTRCQ99895 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTRCQ99895 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTRCQ99895 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTRCQ99895 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTRCQ99895 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTRCQ99895 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTRCQ99895 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTRCQ99895 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CTRCQ99895 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTRCQ99895 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CTRCQ99895 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTRCQ99895 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTRCQ99895 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTRCQ99895 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTRCQ99895 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTRCQ99895 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTRCQ99895 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CTRCQ99895 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTRCQ99895 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTRCQ99895 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTRCQ99895 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTRCQ99895 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CTRCQ99895 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTRCQ99895 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTRCQ99895 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTRCQ99895 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTRCQ99895 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTRCQ99895 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTRCQ99895 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTRCQ99895 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTRCQ99895 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTRCQ99895 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTRCQ99895 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTRCQ99895 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTRCQ99895 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTRCQ99895 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTRCQ99895 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTRCQ99895 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTRCQ99895 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTRCQ99895 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTRCQ99895 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTRCQ99895 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTRCQ99895 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTRCQ99895 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTRCQ99895 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTRCQ99895 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTRCQ99895 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTRCQ99895 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTRCQ99895 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTRCQ99895 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTRCQ99895 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTRCQ99895 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTRCQ99895 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTRCQ99895 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTRCQ99895 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTRCQ99895 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTRCQ99895 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTRCQ99895 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTRCQ99895 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTRCQ99895 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTRCQ99895 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CTRCQ99895 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CTRCQ99895 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTRCQ99895 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTRCQ99895 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTRCQ99895 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTRCQ99895 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTRCQ99895 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTRCQ99895 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTRCQ99895 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTRCQ99895 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CTRCQ99895 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTRCQ99895 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTRCQ99895 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTRCQ99895 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTRCQ99895 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTRCQ99895 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTRCQ99895 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTRCQ99895 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTRCQ99895 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTRCQ99895 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms