Protein–RNA interactions for Protein: Q99829

CPNE1, Copine-1, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE1Q99829 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPNE1Q99829 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPNE1Q99829 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPNE1Q99829 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CPNE1Q99829 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CPNE1Q99829 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPNE1Q99829 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPNE1Q99829 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPNE1Q99829 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPNE1Q99829 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPNE1Q99829 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPNE1Q99829 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPNE1Q99829 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPNE1Q99829 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPNE1Q99829 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPNE1Q99829 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPNE1Q99829 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CPNE1Q99829 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPNE1Q99829 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPNE1Q99829 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPNE1Q99829 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPNE1Q99829 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPNE1Q99829 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPNE1Q99829 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPNE1Q99829 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPNE1Q99829 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPNE1Q99829 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPNE1Q99829 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPNE1Q99829 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPNE1Q99829 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPNE1Q99829 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CPNE1Q99829 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPNE1Q99829 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPNE1Q99829 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPNE1Q99829 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPNE1Q99829 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPNE1Q99829 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPNE1Q99829 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPNE1Q99829 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPNE1Q99829 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPNE1Q99829 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPNE1Q99829 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPNE1Q99829 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPNE1Q99829 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPNE1Q99829 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPNE1Q99829 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPNE1Q99829 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPNE1Q99829 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPNE1Q99829 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPNE1Q99829 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPNE1Q99829 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPNE1Q99829 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPNE1Q99829 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPNE1Q99829 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPNE1Q99829 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPNE1Q99829 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPNE1Q99829 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPNE1Q99829 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CPNE1Q99829 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPNE1Q99829 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPNE1Q99829 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPNE1Q99829 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPNE1Q99829 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPNE1Q99829 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPNE1Q99829 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPNE1Q99829 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPNE1Q99829 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPNE1Q99829 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPNE1Q99829 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPNE1Q99829 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPNE1Q99829 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPNE1Q99829 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPNE1Q99829 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPNE1Q99829 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPNE1Q99829 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPNE1Q99829 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPNE1Q99829 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPNE1Q99829 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPNE1Q99829 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPNE1Q99829 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPNE1Q99829 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPNE1Q99829 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPNE1Q99829 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPNE1Q99829 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPNE1Q99829 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPNE1Q99829 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPNE1Q99829 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPNE1Q99829 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPNE1Q99829 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPNE1Q99829 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CPNE1Q99829 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPNE1Q99829 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPNE1Q99829 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPNE1Q99829 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CPNE1Q99829 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPNE1Q99829 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPNE1Q99829 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPNE1Q99829 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPNE1Q99829 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPNE1Q99829 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms