Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBBP8Q99708 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBBP8Q99708 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBBP8Q99708 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBBP8Q99708 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBBP8Q99708 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBBP8Q99708 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBBP8Q99708 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBBP8Q99708 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBBP8Q99708 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBBP8Q99708 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBBP8Q99708 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBBP8Q99708 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBBP8Q99708 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBBP8Q99708 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBBP8Q99708 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBBP8Q99708 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBBP8Q99708 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBBP8Q99708 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBBP8Q99708 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBBP8Q99708 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBBP8Q99708 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBBP8Q99708 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBBP8Q99708 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBBP8Q99708 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBBP8Q99708 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RBBP8Q99708 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBBP8Q99708 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBBP8Q99708 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBBP8Q99708 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBBP8Q99708 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBBP8Q99708 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBBP8Q99708 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBBP8Q99708 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBBP8Q99708 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RBBP8Q99708 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBBP8Q99708 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBBP8Q99708 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBBP8Q99708 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBBP8Q99708 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBBP8Q99708 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBBP8Q99708 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBBP8Q99708 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBBP8Q99708 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBBP8Q99708 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBBP8Q99708 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBBP8Q99708 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBBP8Q99708 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBBP8Q99708 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBBP8Q99708 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBBP8Q99708 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBBP8Q99708 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBBP8Q99708 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBBP8Q99708 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBBP8Q99708 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBBP8Q99708 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBBP8Q99708 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBBP8Q99708 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBBP8Q99708 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RBBP8Q99708 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBBP8Q99708 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBBP8Q99708 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBBP8Q99708 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBBP8Q99708 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBBP8Q99708 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBBP8Q99708 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBBP8Q99708 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBBP8Q99708 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBBP8Q99708 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBBP8Q99708 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBBP8Q99708 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBBP8Q99708 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBBP8Q99708 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBBP8Q99708 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBBP8Q99708 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBBP8Q99708 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBBP8Q99708 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBBP8Q99708 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBBP8Q99708 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBBP8Q99708 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBBP8Q99708 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBBP8Q99708 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBBP8Q99708 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBBP8Q99708 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBBP8Q99708 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBBP8Q99708 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RBBP8Q99708 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBBP8Q99708 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBBP8Q99708 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBBP8Q99708 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBBP8Q99708 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBBP8Q99708 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBBP8Q99708 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBBP8Q99708 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBBP8Q99708 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBBP8Q99708 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBBP8Q99708 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBBP8Q99708 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBBP8Q99708 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBBP8Q99708 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms