Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKP4Q99569 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PKP4Q99569 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PKP4Q99569 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKP4Q99569 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKP4Q99569 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PKP4Q99569 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKP4Q99569 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PKP4Q99569 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKP4Q99569 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKP4Q99569 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKP4Q99569 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKP4Q99569 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PKP4Q99569 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKP4Q99569 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKP4Q99569 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKP4Q99569 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKP4Q99569 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKP4Q99569 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKP4Q99569 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKP4Q99569 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKP4Q99569 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKP4Q99569 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKP4Q99569 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKP4Q99569 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKP4Q99569 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKP4Q99569 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKP4Q99569 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKP4Q99569 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKP4Q99569 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PKP4Q99569 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKP4Q99569 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKP4Q99569 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKP4Q99569 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKP4Q99569 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKP4Q99569 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKP4Q99569 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKP4Q99569 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKP4Q99569 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKP4Q99569 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKP4Q99569 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKP4Q99569 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKP4Q99569 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKP4Q99569 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKP4Q99569 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKP4Q99569 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKP4Q99569 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKP4Q99569 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKP4Q99569 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKP4Q99569 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP4Q99569 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP4Q99569 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP4Q99569 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP4Q99569 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP4Q99569 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP4Q99569 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP4Q99569 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP4Q99569 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP4Q99569 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP4Q99569 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP4Q99569 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP4Q99569 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKP4Q99569 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKP4Q99569 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKP4Q99569 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKP4Q99569 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKP4Q99569 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKP4Q99569 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKP4Q99569 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKP4Q99569 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PKP4Q99569 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PKP4Q99569 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKP4Q99569 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKP4Q99569 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKP4Q99569 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKP4Q99569 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKP4Q99569 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKP4Q99569 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKP4Q99569 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKP4Q99569 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKP4Q99569 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKP4Q99569 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PKP4Q99569 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKP4Q99569 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKP4Q99569 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKP4Q99569 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKP4Q99569 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PKP4Q99569 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PKP4Q99569 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKP4Q99569 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKP4Q99569 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP4Q99569 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP4Q99569 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP4Q99569 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP4Q99569 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP4Q99569 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP4Q99569 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP4Q99569 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP4Q99569 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKP4Q99569 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms