Protein–RNA interactions for Protein: Q96SM3

CPXM1, Probable carboxypeptidase X1, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPXM1Q96SM3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPXM1Q96SM3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CPXM1Q96SM3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPXM1Q96SM3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPXM1Q96SM3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPXM1Q96SM3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CPXM1Q96SM3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPXM1Q96SM3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPXM1Q96SM3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPXM1Q96SM3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPXM1Q96SM3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPXM1Q96SM3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPXM1Q96SM3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPXM1Q96SM3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPXM1Q96SM3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPXM1Q96SM3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPXM1Q96SM3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CPXM1Q96SM3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CPXM1Q96SM3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPXM1Q96SM3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPXM1Q96SM3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPXM1Q96SM3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPXM1Q96SM3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CPXM1Q96SM3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CPXM1Q96SM3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CPXM1Q96SM3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CPXM1Q96SM3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CPXM1Q96SM3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CPXM1Q96SM3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CPXM1Q96SM3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CPXM1Q96SM3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CPXM1Q96SM3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPXM1Q96SM3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPXM1Q96SM3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPXM1Q96SM3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPXM1Q96SM3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPXM1Q96SM3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPXM1Q96SM3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPXM1Q96SM3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPXM1Q96SM3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPXM1Q96SM3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CPXM1Q96SM3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPXM1Q96SM3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPXM1Q96SM3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPXM1Q96SM3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CPXM1Q96SM3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPXM1Q96SM3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPXM1Q96SM3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPXM1Q96SM3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPXM1Q96SM3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CPXM1Q96SM3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPXM1Q96SM3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPXM1Q96SM3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPXM1Q96SM3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPXM1Q96SM3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPXM1Q96SM3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPXM1Q96SM3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CPXM1Q96SM3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPXM1Q96SM3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPXM1Q96SM3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPXM1Q96SM3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPXM1Q96SM3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPXM1Q96SM3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPXM1Q96SM3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CPXM1Q96SM3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPXM1Q96SM3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPXM1Q96SM3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPXM1Q96SM3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPXM1Q96SM3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPXM1Q96SM3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPXM1Q96SM3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPXM1Q96SM3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPXM1Q96SM3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CPXM1Q96SM3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CPXM1Q96SM3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CPXM1Q96SM3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPXM1Q96SM3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPXM1Q96SM3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPXM1Q96SM3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CPXM1Q96SM3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPXM1Q96SM3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CPXM1Q96SM3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPXM1Q96SM3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPXM1Q96SM3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPXM1Q96SM3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPXM1Q96SM3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPXM1Q96SM3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CPXM1Q96SM3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPXM1Q96SM3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPXM1Q96SM3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPXM1Q96SM3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPXM1Q96SM3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPXM1Q96SM3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPXM1Q96SM3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPXM1Q96SM3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPXM1Q96SM3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPXM1Q96SM3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPXM1Q96SM3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPXM1Q96SM3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPXM1Q96SM3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms