Protein–RNA interactions for Protein: Q96S55

WRNIP1, ATPase WRNIP1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WRNIP1Q96S55 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
WRNIP1Q96S55 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
WRNIP1Q96S55 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
WRNIP1Q96S55 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
WRNIP1Q96S55 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
WRNIP1Q96S55 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
WRNIP1Q96S55 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
WRNIP1Q96S55 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
WRNIP1Q96S55 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
WRNIP1Q96S55 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
WRNIP1Q96S55 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
WRNIP1Q96S55 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.56■■■□□ 2
WRNIP1Q96S55 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.56■■■□□ 2
WRNIP1Q96S55 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
WRNIP1Q96S55 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
WRNIP1Q96S55 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
WRNIP1Q96S55 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
WRNIP1Q96S55 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
WRNIP1Q96S55 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
WRNIP1Q96S55 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
WRNIP1Q96S55 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.54■■■□□ 2
WRNIP1Q96S55 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.54■■■□□ 2
WRNIP1Q96S55 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
WRNIP1Q96S55 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
WRNIP1Q96S55 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
WRNIP1Q96S55 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.53■■■□□ 2
WRNIP1Q96S55 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
WRNIP1Q96S55 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
WRNIP1Q96S55 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
WRNIP1Q96S55 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
WRNIP1Q96S55 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
WRNIP1Q96S55 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
WRNIP1Q96S55 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
WRNIP1Q96S55 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
WRNIP1Q96S55 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.52■■■□□ 2
WRNIP1Q96S55 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.52■■■□□ 2
WRNIP1Q96S55 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
WRNIP1Q96S55 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
WRNIP1Q96S55 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
WRNIP1Q96S55 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
WRNIP1Q96S55 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
WRNIP1Q96S55 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
WRNIP1Q96S55 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
WRNIP1Q96S55 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
WRNIP1Q96S55 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
WRNIP1Q96S55 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
WRNIP1Q96S55 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
WRNIP1Q96S55 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
WRNIP1Q96S55 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
WRNIP1Q96S55 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
WRNIP1Q96S55 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
WRNIP1Q96S55 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
WRNIP1Q96S55 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
WRNIP1Q96S55 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
WRNIP1Q96S55 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
WRNIP1Q96S55 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
WRNIP1Q96S55 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
WRNIP1Q96S55 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
WRNIP1Q96S55 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
WRNIP1Q96S55 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
WRNIP1Q96S55 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
WRNIP1Q96S55 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
WRNIP1Q96S55 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
WRNIP1Q96S55 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
WRNIP1Q96S55 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
WRNIP1Q96S55 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
WRNIP1Q96S55 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
WRNIP1Q96S55 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
WRNIP1Q96S55 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
WRNIP1Q96S55 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
WRNIP1Q96S55 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
WRNIP1Q96S55 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
WRNIP1Q96S55 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
WRNIP1Q96S55 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
WRNIP1Q96S55 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
WRNIP1Q96S55 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
WRNIP1Q96S55 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
WRNIP1Q96S55 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
WRNIP1Q96S55 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
WRNIP1Q96S55 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
WRNIP1Q96S55 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
WRNIP1Q96S55 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
WRNIP1Q96S55 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
WRNIP1Q96S55 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
WRNIP1Q96S55 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
WRNIP1Q96S55 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
WRNIP1Q96S55 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
WRNIP1Q96S55 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
WRNIP1Q96S55 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
WRNIP1Q96S55 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
WRNIP1Q96S55 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
WRNIP1Q96S55 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
WRNIP1Q96S55 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
WRNIP1Q96S55 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
WRNIP1Q96S55 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
WRNIP1Q96S55 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
WRNIP1Q96S55 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
WRNIP1Q96S55 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
WRNIP1Q96S55 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
WRNIP1Q96S55 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms