Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBGCP5Q96RT8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBGCP5Q96RT8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBGCP5Q96RT8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBGCP5Q96RT8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBGCP5Q96RT8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBGCP5Q96RT8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBGCP5Q96RT8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBGCP5Q96RT8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBGCP5Q96RT8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBGCP5Q96RT8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBGCP5Q96RT8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBGCP5Q96RT8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBGCP5Q96RT8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBGCP5Q96RT8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBGCP5Q96RT8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBGCP5Q96RT8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBGCP5Q96RT8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBGCP5Q96RT8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBGCP5Q96RT8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBGCP5Q96RT8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBGCP5Q96RT8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBGCP5Q96RT8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBGCP5Q96RT8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBGCP5Q96RT8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBGCP5Q96RT8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBGCP5Q96RT8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBGCP5Q96RT8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBGCP5Q96RT8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBGCP5Q96RT8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBGCP5Q96RT8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBGCP5Q96RT8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBGCP5Q96RT8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBGCP5Q96RT8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBGCP5Q96RT8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBGCP5Q96RT8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBGCP5Q96RT8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBGCP5Q96RT8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBGCP5Q96RT8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBGCP5Q96RT8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBGCP5Q96RT8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBGCP5Q96RT8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBGCP5Q96RT8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBGCP5Q96RT8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBGCP5Q96RT8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBGCP5Q96RT8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TUBGCP5Q96RT8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBGCP5Q96RT8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBGCP5Q96RT8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBGCP5Q96RT8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBGCP5Q96RT8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBGCP5Q96RT8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBGCP5Q96RT8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBGCP5Q96RT8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBGCP5Q96RT8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBGCP5Q96RT8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBGCP5Q96RT8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBGCP5Q96RT8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBGCP5Q96RT8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBGCP5Q96RT8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBGCP5Q96RT8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBGCP5Q96RT8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBGCP5Q96RT8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBGCP5Q96RT8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBGCP5Q96RT8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBGCP5Q96RT8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBGCP5Q96RT8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBGCP5Q96RT8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBGCP5Q96RT8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBGCP5Q96RT8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBGCP5Q96RT8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBGCP5Q96RT8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBGCP5Q96RT8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBGCP5Q96RT8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBGCP5Q96RT8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBGCP5Q96RT8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBGCP5Q96RT8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBGCP5Q96RT8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBGCP5Q96RT8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBGCP5Q96RT8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBGCP5Q96RT8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBGCP5Q96RT8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBGCP5Q96RT8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBGCP5Q96RT8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBGCP5Q96RT8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBGCP5Q96RT8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBGCP5Q96RT8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms