Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD5

DEPDC7, DEP domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC7Q96QD5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DEPDC7Q96QD5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DEPDC7Q96QD5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DEPDC7Q96QD5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DEPDC7Q96QD5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DEPDC7Q96QD5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DEPDC7Q96QD5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DEPDC7Q96QD5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DEPDC7Q96QD5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DEPDC7Q96QD5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DEPDC7Q96QD5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DEPDC7Q96QD5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DEPDC7Q96QD5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DEPDC7Q96QD5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DEPDC7Q96QD5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DEPDC7Q96QD5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DEPDC7Q96QD5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DEPDC7Q96QD5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DEPDC7Q96QD5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DEPDC7Q96QD5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DEPDC7Q96QD5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DEPDC7Q96QD5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DEPDC7Q96QD5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DEPDC7Q96QD5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DEPDC7Q96QD5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DEPDC7Q96QD5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DEPDC7Q96QD5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DEPDC7Q96QD5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DEPDC7Q96QD5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DEPDC7Q96QD5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DEPDC7Q96QD5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DEPDC7Q96QD5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DEPDC7Q96QD5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DEPDC7Q96QD5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DEPDC7Q96QD5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DEPDC7Q96QD5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DEPDC7Q96QD5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DEPDC7Q96QD5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DEPDC7Q96QD5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DEPDC7Q96QD5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DEPDC7Q96QD5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DEPDC7Q96QD5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DEPDC7Q96QD5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DEPDC7Q96QD5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DEPDC7Q96QD5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DEPDC7Q96QD5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DEPDC7Q96QD5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DEPDC7Q96QD5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DEPDC7Q96QD5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DEPDC7Q96QD5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DEPDC7Q96QD5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DEPDC7Q96QD5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DEPDC7Q96QD5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DEPDC7Q96QD5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DEPDC7Q96QD5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DEPDC7Q96QD5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms