Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
ALS2Q96Q42 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
ALS2Q96Q42 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
ALS2Q96Q42 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
ALS2Q96Q42 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
ALS2Q96Q42 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
ALS2Q96Q42 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
ALS2Q96Q42 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
ALS2Q96Q42 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
ALS2Q96Q42 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
ALS2Q96Q42 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
ALS2Q96Q42 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
ALS2Q96Q42 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
ALS2Q96Q42 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
ALS2Q96Q42 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
ALS2Q96Q42 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
ALS2Q96Q42 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
ALS2Q96Q42 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
ALS2Q96Q42 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
ALS2Q96Q42 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
ALS2Q96Q42 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
ALS2Q96Q42 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
ALS2Q96Q42 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
ALS2Q96Q42 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
ALS2Q96Q42 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
ALS2Q96Q42 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
ALS2Q96Q42 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
ALS2Q96Q42 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
ALS2Q96Q42 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
ALS2Q96Q42 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
ALS2Q96Q42 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
ALS2Q96Q42 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
ALS2Q96Q42 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
ALS2Q96Q42 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
ALS2Q96Q42 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
ALS2Q96Q42 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
ALS2Q96Q42 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
ALS2Q96Q42 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
ALS2Q96Q42 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
ALS2Q96Q42 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
ALS2Q96Q42 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
ALS2Q96Q42 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
ALS2Q96Q42 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
ALS2Q96Q42 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
ALS2Q96Q42 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
ALS2Q96Q42 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
ALS2Q96Q42 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
ALS2Q96Q42 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
ALS2Q96Q42 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
ALS2Q96Q42 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC31.84■■■□□ 2.69
ALS2Q96Q42 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
ALS2Q96Q42 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
ALS2Q96Q42 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
ALS2Q96Q42 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
ALS2Q96Q42 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
ALS2Q96Q42 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
ALS2Q96Q42 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
ALS2Q96Q42 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
ALS2Q96Q42 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
ALS2Q96Q42 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
ALS2Q96Q42 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
ALS2Q96Q42 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
ALS2Q96Q42 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
ALS2Q96Q42 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
ALS2Q96Q42 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
ALS2Q96Q42 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
ALS2Q96Q42 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
ALS2Q96Q42 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
ALS2Q96Q42 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
ALS2Q96Q42 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
ALS2Q96Q42 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
ALS2Q96Q42 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
ALS2Q96Q42 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
ALS2Q96Q42 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
ALS2Q96Q42 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
ALS2Q96Q42 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
ALS2Q96Q42 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
ALS2Q96Q42 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
ALS2Q96Q42 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
ALS2Q96Q42 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
ALS2Q96Q42 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
ALS2Q96Q42 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
ALS2Q96Q42 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
ALS2Q96Q42 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
ALS2Q96Q42 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
ALS2Q96Q42 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
ALS2Q96Q42 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
ALS2Q96Q42 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
ALS2Q96Q42 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
ALS2Q96Q42 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
ALS2Q96Q42 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
ALS2Q96Q42 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
ALS2Q96Q42 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
ALS2Q96Q42 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
ALS2Q96Q42 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
ALS2Q96Q42 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
ALS2Q96Q42 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
ALS2Q96Q42 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
ALS2Q96Q42 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
ALS2Q96Q42 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms