Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC9Q96Q05 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC9Q96Q05 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC9Q96Q05 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC9Q96Q05 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC9Q96Q05 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC9Q96Q05 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC9Q96Q05 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC9Q96Q05 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC9Q96Q05 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC9Q96Q05 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC9Q96Q05 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC9Q96Q05 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC9Q96Q05 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC9Q96Q05 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC9Q96Q05 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC9Q96Q05 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC9Q96Q05 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC9Q96Q05 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC9Q96Q05 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC9Q96Q05 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC9Q96Q05 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC9Q96Q05 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC9Q96Q05 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC9Q96Q05 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC9Q96Q05 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC9Q96Q05 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC9Q96Q05 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC9Q96Q05 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC9Q96Q05 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC9Q96Q05 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC9Q96Q05 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC9Q96Q05 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC9Q96Q05 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC9Q96Q05 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC9Q96Q05 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC9Q96Q05 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC9Q96Q05 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC9Q96Q05 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC9Q96Q05 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC9Q96Q05 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC9Q96Q05 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC9Q96Q05 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC9Q96Q05 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC9Q96Q05 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC9Q96Q05 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC9Q96Q05 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC9Q96Q05 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC9Q96Q05 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC9Q96Q05 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC9Q96Q05 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC9Q96Q05 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC9Q96Q05 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC9Q96Q05 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC9Q96Q05 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC9Q96Q05 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC9Q96Q05 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC9Q96Q05 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC9Q96Q05 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC9Q96Q05 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC9Q96Q05 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC9Q96Q05 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC9Q96Q05 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC9Q96Q05 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC9Q96Q05 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC9Q96Q05 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC9Q96Q05 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC9Q96Q05 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC9Q96Q05 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC9Q96Q05 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC9Q96Q05 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC9Q96Q05 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC9Q96Q05 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC9Q96Q05 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC9Q96Q05 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC9Q96Q05 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC9Q96Q05 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC9Q96Q05 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC9Q96Q05 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TRAPPC9Q96Q05 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC9Q96Q05 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms