Protein–RNA interactions for Protein: Q96P48

ARAP1, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAP1Q96P48 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
ARAP1Q96P48 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC38.65■■■■□ 3.78
ARAP1Q96P48 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
ARAP1Q96P48 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
ARAP1Q96P48 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
ARAP1Q96P48 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
ARAP1Q96P48 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
ARAP1Q96P48 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
ARAP1Q96P48 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
ARAP1Q96P48 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
ARAP1Q96P48 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
ARAP1Q96P48 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
ARAP1Q96P48 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
ARAP1Q96P48 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
ARAP1Q96P48 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
ARAP1Q96P48 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
ARAP1Q96P48 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
ARAP1Q96P48 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
ARAP1Q96P48 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
ARAP1Q96P48 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
ARAP1Q96P48 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
ARAP1Q96P48 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
ARAP1Q96P48 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
ARAP1Q96P48 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
ARAP1Q96P48 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
ARAP1Q96P48 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
ARAP1Q96P48 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
ARAP1Q96P48 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
ARAP1Q96P48 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
ARAP1Q96P48 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
ARAP1Q96P48 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.77
ARAP1Q96P48 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
ARAP1Q96P48 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
ARAP1Q96P48 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
ARAP1Q96P48 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
ARAP1Q96P48 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC38.56■■■■□ 3.76
ARAP1Q96P48 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
ARAP1Q96P48 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
ARAP1Q96P48 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
ARAP1Q96P48 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
ARAP1Q96P48 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
ARAP1Q96P48 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
ARAP1Q96P48 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC38.54■■■■□ 3.76
ARAP1Q96P48 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
ARAP1Q96P48 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
ARAP1Q96P48 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
ARAP1Q96P48 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC38.54■■■■□ 3.76
ARAP1Q96P48 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
ARAP1Q96P48 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
ARAP1Q96P48 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
ARAP1Q96P48 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
ARAP1Q96P48 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
ARAP1Q96P48 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
ARAP1Q96P48 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
ARAP1Q96P48 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
ARAP1Q96P48 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
ARAP1Q96P48 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC38.53■■■■□ 3.76
ARAP1Q96P48 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC38.53■■■■□ 3.76
ARAP1Q96P48 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
ARAP1Q96P48 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC38.53■■■■□ 3.76
ARAP1Q96P48 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC38.53■■■■□ 3.76
ARAP1Q96P48 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
ARAP1Q96P48 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
ARAP1Q96P48 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC38.52■■■■□ 3.76
ARAP1Q96P48 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
ARAP1Q96P48 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
ARAP1Q96P48 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
ARAP1Q96P48 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
ARAP1Q96P48 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
ARAP1Q96P48 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
ARAP1Q96P48 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
ARAP1Q96P48 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
ARAP1Q96P48 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
ARAP1Q96P48 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC38.49■■■■□ 3.75
ARAP1Q96P48 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
ARAP1Q96P48 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC38.49■■■■□ 3.75
ARAP1Q96P48 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
ARAP1Q96P48 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC38.49■■■■□ 3.75
ARAP1Q96P48 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
ARAP1Q96P48 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
ARAP1Q96P48 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
ARAP1Q96P48 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
ARAP1Q96P48 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
ARAP1Q96P48 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
ARAP1Q96P48 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
ARAP1Q96P48 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
ARAP1Q96P48 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
ARAP1Q96P48 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC38.46■■■■□ 3.75
ARAP1Q96P48 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
ARAP1Q96P48 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
ARAP1Q96P48 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
ARAP1Q96P48 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
ARAP1Q96P48 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
ARAP1Q96P48 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
ARAP1Q96P48 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
ARAP1Q96P48 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
ARAP1Q96P48 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
ARAP1Q96P48 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
ARAP1Q96P48 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
ARAP1Q96P48 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms