Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM47Q96LD4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM47Q96LD4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM47Q96LD4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM47Q96LD4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM47Q96LD4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM47Q96LD4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM47Q96LD4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM47Q96LD4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM47Q96LD4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM47Q96LD4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM47Q96LD4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM47Q96LD4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM47Q96LD4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM47Q96LD4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM47Q96LD4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM47Q96LD4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM47Q96LD4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM47Q96LD4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM47Q96LD4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM47Q96LD4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM47Q96LD4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM47Q96LD4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM47Q96LD4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM47Q96LD4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM47Q96LD4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM47Q96LD4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM47Q96LD4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM47Q96LD4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM47Q96LD4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM47Q96LD4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM47Q96LD4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM47Q96LD4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM47Q96LD4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM47Q96LD4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM47Q96LD4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM47Q96LD4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM47Q96LD4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM47Q96LD4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM47Q96LD4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM47Q96LD4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM47Q96LD4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM47Q96LD4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM47Q96LD4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM47Q96LD4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM47Q96LD4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM47Q96LD4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM47Q96LD4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM47Q96LD4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM47Q96LD4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM47Q96LD4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM47Q96LD4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM47Q96LD4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM47Q96LD4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM47Q96LD4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM47Q96LD4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM47Q96LD4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM47Q96LD4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM47Q96LD4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM47Q96LD4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM47Q96LD4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM47Q96LD4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM47Q96LD4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM47Q96LD4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM47Q96LD4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM47Q96LD4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM47Q96LD4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM47Q96LD4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM47Q96LD4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM47Q96LD4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM47Q96LD4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM47Q96LD4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM47Q96LD4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM47Q96LD4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM47Q96LD4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM47Q96LD4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRIM47Q96LD4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM47Q96LD4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM47Q96LD4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM47Q96LD4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM47Q96LD4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM47Q96LD4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM47Q96LD4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM47Q96LD4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM47Q96LD4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM47Q96LD4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM47Q96LD4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM47Q96LD4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM47Q96LD4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM47Q96LD4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM47Q96LD4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM47Q96LD4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM47Q96LD4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM47Q96LD4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM47Q96LD4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM47Q96LD4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM47Q96LD4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM47Q96LD4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM47Q96LD4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM47Q96LD4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms