Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN0

LCOR, Ligand-dependent corepressor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCORQ96JN0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LCORQ96JN0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LCORQ96JN0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LCORQ96JN0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LCORQ96JN0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LCORQ96JN0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LCORQ96JN0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LCORQ96JN0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LCORQ96JN0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LCORQ96JN0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LCORQ96JN0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LCORQ96JN0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LCORQ96JN0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LCORQ96JN0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LCORQ96JN0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LCORQ96JN0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LCORQ96JN0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LCORQ96JN0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LCORQ96JN0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LCORQ96JN0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LCORQ96JN0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LCORQ96JN0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LCORQ96JN0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LCORQ96JN0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LCORQ96JN0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LCORQ96JN0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LCORQ96JN0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LCORQ96JN0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LCORQ96JN0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LCORQ96JN0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LCORQ96JN0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LCORQ96JN0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LCORQ96JN0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LCORQ96JN0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LCORQ96JN0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LCORQ96JN0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LCORQ96JN0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LCORQ96JN0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LCORQ96JN0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LCORQ96JN0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCORQ96JN0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCORQ96JN0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCORQ96JN0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCORQ96JN0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCORQ96JN0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCORQ96JN0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCORQ96JN0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCORQ96JN0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LCORQ96JN0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LCORQ96JN0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LCORQ96JN0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LCORQ96JN0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LCORQ96JN0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LCORQ96JN0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LCORQ96JN0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCORQ96JN0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCORQ96JN0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCORQ96JN0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCORQ96JN0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCORQ96JN0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCORQ96JN0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCORQ96JN0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCORQ96JN0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCORQ96JN0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCORQ96JN0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCORQ96JN0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCORQ96JN0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCORQ96JN0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCORQ96JN0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCORQ96JN0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCORQ96JN0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCORQ96JN0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCORQ96JN0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LCORQ96JN0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCORQ96JN0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCORQ96JN0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCORQ96JN0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LCORQ96JN0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LCORQ96JN0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LCORQ96JN0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LCORQ96JN0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LCORQ96JN0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LCORQ96JN0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LCORQ96JN0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LCORQ96JN0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LCORQ96JN0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LCORQ96JN0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LCORQ96JN0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LCORQ96JN0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LCORQ96JN0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LCORQ96JN0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LCORQ96JN0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LCORQ96JN0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LCORQ96JN0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LCORQ96JN0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LCORQ96JN0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LCORQ96JN0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LCORQ96JN0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LCORQ96JN0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LCORQ96JN0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms