Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRIG1Q96JA1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRIG1Q96JA1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRIG1Q96JA1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRIG1Q96JA1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRIG1Q96JA1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRIG1Q96JA1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRIG1Q96JA1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRIG1Q96JA1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRIG1Q96JA1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRIG1Q96JA1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRIG1Q96JA1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRIG1Q96JA1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRIG1Q96JA1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRIG1Q96JA1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRIG1Q96JA1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRIG1Q96JA1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRIG1Q96JA1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRIG1Q96JA1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRIG1Q96JA1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRIG1Q96JA1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRIG1Q96JA1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRIG1Q96JA1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRIG1Q96JA1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRIG1Q96JA1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRIG1Q96JA1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRIG1Q96JA1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRIG1Q96JA1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRIG1Q96JA1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRIG1Q96JA1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRIG1Q96JA1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRIG1Q96JA1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRIG1Q96JA1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRIG1Q96JA1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRIG1Q96JA1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRIG1Q96JA1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRIG1Q96JA1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRIG1Q96JA1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRIG1Q96JA1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRIG1Q96JA1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRIG1Q96JA1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRIG1Q96JA1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRIG1Q96JA1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRIG1Q96JA1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRIG1Q96JA1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRIG1Q96JA1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRIG1Q96JA1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LRIG1Q96JA1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRIG1Q96JA1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRIG1Q96JA1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRIG1Q96JA1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRIG1Q96JA1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRIG1Q96JA1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRIG1Q96JA1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRIG1Q96JA1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRIG1Q96JA1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRIG1Q96JA1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRIG1Q96JA1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRIG1Q96JA1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRIG1Q96JA1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRIG1Q96JA1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRIG1Q96JA1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRIG1Q96JA1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRIG1Q96JA1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LRIG1Q96JA1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRIG1Q96JA1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRIG1Q96JA1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRIG1Q96JA1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRIG1Q96JA1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRIG1Q96JA1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRIG1Q96JA1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRIG1Q96JA1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRIG1Q96JA1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRIG1Q96JA1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LRIG1Q96JA1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LRIG1Q96JA1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRIG1Q96JA1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRIG1Q96JA1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRIG1Q96JA1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRIG1Q96JA1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LRIG1Q96JA1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LRIG1Q96JA1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRIG1Q96JA1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRIG1Q96JA1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRIG1Q96JA1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRIG1Q96JA1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRIG1Q96JA1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRIG1Q96JA1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRIG1Q96JA1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRIG1Q96JA1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRIG1Q96JA1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRIG1Q96JA1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRIG1Q96JA1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRIG1Q96JA1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRIG1Q96JA1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRIG1Q96JA1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRIG1Q96JA1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRIG1Q96JA1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRIG1Q96JA1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRIG1Q96JA1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1318.7 ms