Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CELF6Q96J87 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CELF6Q96J87 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CELF6Q96J87 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CELF6Q96J87 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CELF6Q96J87 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CELF6Q96J87 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CELF6Q96J87 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CELF6Q96J87 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CELF6Q96J87 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CELF6Q96J87 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CELF6Q96J87 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CELF6Q96J87 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CELF6Q96J87 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CELF6Q96J87 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CELF6Q96J87 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CELF6Q96J87 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CELF6Q96J87 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CELF6Q96J87 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CELF6Q96J87 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CELF6Q96J87 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CELF6Q96J87 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CELF6Q96J87 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CELF6Q96J87 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CELF6Q96J87 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CELF6Q96J87 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CELF6Q96J87 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CELF6Q96J87 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CELF6Q96J87 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CELF6Q96J87 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CELF6Q96J87 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CELF6Q96J87 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CELF6Q96J87 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CELF6Q96J87 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CELF6Q96J87 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CELF6Q96J87 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CELF6Q96J87 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CELF6Q96J87 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CELF6Q96J87 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CELF6Q96J87 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CELF6Q96J87 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CELF6Q96J87 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CELF6Q96J87 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CELF6Q96J87 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CELF6Q96J87 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CELF6Q96J87 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CELF6Q96J87 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CELF6Q96J87 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CELF6Q96J87 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CELF6Q96J87 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CELF6Q96J87 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CELF6Q96J87 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CELF6Q96J87 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CELF6Q96J87 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CELF6Q96J87 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CELF6Q96J87 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CELF6Q96J87 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CELF6Q96J87 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CELF6Q96J87 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CELF6Q96J87 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CELF6Q96J87 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CELF6Q96J87 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CELF6Q96J87 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CELF6Q96J87 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CELF6Q96J87 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CELF6Q96J87 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CELF6Q96J87 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CELF6Q96J87 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CELF6Q96J87 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CELF6Q96J87 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CELF6Q96J87 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CELF6Q96J87 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CELF6Q96J87 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CELF6Q96J87 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CELF6Q96J87 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CELF6Q96J87 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CELF6Q96J87 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CELF6Q96J87 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CELF6Q96J87 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CELF6Q96J87 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CELF6Q96J87 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CELF6Q96J87 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CELF6Q96J87 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CELF6Q96J87 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CELF6Q96J87 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CELF6Q96J87 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CELF6Q96J87 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CELF6Q96J87 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CELF6Q96J87 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CELF6Q96J87 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CELF6Q96J87 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CELF6Q96J87 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CELF6Q96J87 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CELF6Q96J87 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CELF6Q96J87 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CELF6Q96J87 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CELF6Q96J87 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CELF6Q96J87 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CELF6Q96J87 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CELF6Q96J87 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms