Protein–RNA interactions for Protein: Q96FS4

SIPA1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1Q96FS4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIPA1Q96FS4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIPA1Q96FS4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIPA1Q96FS4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIPA1Q96FS4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIPA1Q96FS4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIPA1Q96FS4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIPA1Q96FS4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIPA1Q96FS4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIPA1Q96FS4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIPA1Q96FS4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIPA1Q96FS4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIPA1Q96FS4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIPA1Q96FS4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIPA1Q96FS4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIPA1Q96FS4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SIPA1Q96FS4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIPA1Q96FS4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIPA1Q96FS4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIPA1Q96FS4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIPA1Q96FS4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIPA1Q96FS4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIPA1Q96FS4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIPA1Q96FS4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIPA1Q96FS4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIPA1Q96FS4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SIPA1Q96FS4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIPA1Q96FS4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIPA1Q96FS4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIPA1Q96FS4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIPA1Q96FS4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIPA1Q96FS4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIPA1Q96FS4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIPA1Q96FS4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIPA1Q96FS4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIPA1Q96FS4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SIPA1Q96FS4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIPA1Q96FS4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIPA1Q96FS4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIPA1Q96FS4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIPA1Q96FS4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIPA1Q96FS4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIPA1Q96FS4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIPA1Q96FS4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIPA1Q96FS4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIPA1Q96FS4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIPA1Q96FS4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SIPA1Q96FS4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIPA1Q96FS4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIPA1Q96FS4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIPA1Q96FS4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIPA1Q96FS4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIPA1Q96FS4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIPA1Q96FS4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIPA1Q96FS4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIPA1Q96FS4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIPA1Q96FS4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIPA1Q96FS4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIPA1Q96FS4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIPA1Q96FS4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIPA1Q96FS4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SIPA1Q96FS4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIPA1Q96FS4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SIPA1Q96FS4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
SIPA1Q96FS4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIPA1Q96FS4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SIPA1Q96FS4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SIPA1Q96FS4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIPA1Q96FS4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIPA1Q96FS4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIPA1Q96FS4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIPA1Q96FS4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIPA1Q96FS4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIPA1Q96FS4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIPA1Q96FS4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIPA1Q96FS4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIPA1Q96FS4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIPA1Q96FS4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIPA1Q96FS4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIPA1Q96FS4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIPA1Q96FS4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIPA1Q96FS4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SIPA1Q96FS4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIPA1Q96FS4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SIPA1Q96FS4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIPA1Q96FS4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIPA1Q96FS4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIPA1Q96FS4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIPA1Q96FS4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIPA1Q96FS4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIPA1Q96FS4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIPA1Q96FS4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIPA1Q96FS4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIPA1Q96FS4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIPA1Q96FS4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIPA1Q96FS4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIPA1Q96FS4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1Q96FS4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1Q96FS4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1Q96FS4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms