Protein–RNA interactions for Protein: Q96EM0

L3HYPDH, Trans-3-hydroxy-L-proline dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L3HYPDHQ96EM0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
L3HYPDHQ96EM0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
L3HYPDHQ96EM0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
L3HYPDHQ96EM0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
L3HYPDHQ96EM0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
L3HYPDHQ96EM0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
L3HYPDHQ96EM0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
L3HYPDHQ96EM0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
L3HYPDHQ96EM0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
L3HYPDHQ96EM0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
L3HYPDHQ96EM0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
L3HYPDHQ96EM0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
L3HYPDHQ96EM0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
L3HYPDHQ96EM0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
L3HYPDHQ96EM0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
L3HYPDHQ96EM0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
L3HYPDHQ96EM0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
L3HYPDHQ96EM0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
L3HYPDHQ96EM0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
L3HYPDHQ96EM0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
L3HYPDHQ96EM0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
L3HYPDHQ96EM0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
L3HYPDHQ96EM0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
L3HYPDHQ96EM0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
L3HYPDHQ96EM0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
L3HYPDHQ96EM0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
L3HYPDHQ96EM0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
L3HYPDHQ96EM0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
L3HYPDHQ96EM0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
L3HYPDHQ96EM0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
L3HYPDHQ96EM0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
L3HYPDHQ96EM0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
L3HYPDHQ96EM0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
L3HYPDHQ96EM0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
L3HYPDHQ96EM0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
L3HYPDHQ96EM0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
L3HYPDHQ96EM0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
L3HYPDHQ96EM0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
L3HYPDHQ96EM0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
L3HYPDHQ96EM0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
L3HYPDHQ96EM0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
L3HYPDHQ96EM0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
L3HYPDHQ96EM0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
L3HYPDHQ96EM0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
L3HYPDHQ96EM0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
L3HYPDHQ96EM0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
L3HYPDHQ96EM0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
L3HYPDHQ96EM0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
L3HYPDHQ96EM0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
L3HYPDHQ96EM0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
L3HYPDHQ96EM0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
L3HYPDHQ96EM0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
L3HYPDHQ96EM0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
L3HYPDHQ96EM0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
L3HYPDHQ96EM0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
L3HYPDHQ96EM0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
L3HYPDHQ96EM0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
L3HYPDHQ96EM0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
L3HYPDHQ96EM0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
L3HYPDHQ96EM0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
L3HYPDHQ96EM0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
L3HYPDHQ96EM0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
L3HYPDHQ96EM0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
L3HYPDHQ96EM0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
L3HYPDHQ96EM0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
L3HYPDHQ96EM0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
L3HYPDHQ96EM0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
L3HYPDHQ96EM0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
L3HYPDHQ96EM0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
L3HYPDHQ96EM0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
L3HYPDHQ96EM0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
L3HYPDHQ96EM0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
L3HYPDHQ96EM0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
L3HYPDHQ96EM0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
L3HYPDHQ96EM0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
L3HYPDHQ96EM0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
L3HYPDHQ96EM0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
L3HYPDHQ96EM0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
L3HYPDHQ96EM0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
L3HYPDHQ96EM0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
L3HYPDHQ96EM0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
L3HYPDHQ96EM0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
L3HYPDHQ96EM0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
L3HYPDHQ96EM0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
L3HYPDHQ96EM0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
L3HYPDHQ96EM0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
L3HYPDHQ96EM0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
L3HYPDHQ96EM0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
L3HYPDHQ96EM0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
L3HYPDHQ96EM0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
L3HYPDHQ96EM0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
L3HYPDHQ96EM0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
L3HYPDHQ96EM0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
L3HYPDHQ96EM0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
L3HYPDHQ96EM0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
L3HYPDHQ96EM0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
L3HYPDHQ96EM0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
L3HYPDHQ96EM0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
L3HYPDHQ96EM0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
L3HYPDHQ96EM0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms