Protein–RNA interactions for Protein: Q96EA4

SPDL1, Protein Spindly, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDL1Q96EA4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPDL1Q96EA4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SPDL1Q96EA4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPDL1Q96EA4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPDL1Q96EA4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPDL1Q96EA4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPDL1Q96EA4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPDL1Q96EA4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPDL1Q96EA4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPDL1Q96EA4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPDL1Q96EA4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPDL1Q96EA4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPDL1Q96EA4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPDL1Q96EA4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPDL1Q96EA4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPDL1Q96EA4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPDL1Q96EA4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPDL1Q96EA4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPDL1Q96EA4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SPDL1Q96EA4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPDL1Q96EA4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPDL1Q96EA4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SPDL1Q96EA4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPDL1Q96EA4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDL1Q96EA4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDL1Q96EA4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDL1Q96EA4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDL1Q96EA4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDL1Q96EA4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDL1Q96EA4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDL1Q96EA4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDL1Q96EA4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDL1Q96EA4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDL1Q96EA4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDL1Q96EA4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDL1Q96EA4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDL1Q96EA4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDL1Q96EA4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDL1Q96EA4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPDL1Q96EA4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPDL1Q96EA4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SPDL1Q96EA4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPDL1Q96EA4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SPDL1Q96EA4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPDL1Q96EA4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPDL1Q96EA4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPDL1Q96EA4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPDL1Q96EA4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPDL1Q96EA4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPDL1Q96EA4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SPDL1Q96EA4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPDL1Q96EA4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms