Protein–RNA interactions for Protein: Q96DN2

VWCE, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWCEQ96DN2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VWCEQ96DN2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VWCEQ96DN2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VWCEQ96DN2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VWCEQ96DN2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VWCEQ96DN2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VWCEQ96DN2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VWCEQ96DN2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VWCEQ96DN2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VWCEQ96DN2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VWCEQ96DN2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
VWCEQ96DN2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
VWCEQ96DN2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VWCEQ96DN2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VWCEQ96DN2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
VWCEQ96DN2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
VWCEQ96DN2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VWCEQ96DN2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VWCEQ96DN2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VWCEQ96DN2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
VWCEQ96DN2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VWCEQ96DN2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VWCEQ96DN2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VWCEQ96DN2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VWCEQ96DN2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VWCEQ96DN2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VWCEQ96DN2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VWCEQ96DN2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
VWCEQ96DN2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
VWCEQ96DN2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VWCEQ96DN2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VWCEQ96DN2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VWCEQ96DN2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VWCEQ96DN2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VWCEQ96DN2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VWCEQ96DN2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VWCEQ96DN2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VWCEQ96DN2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VWCEQ96DN2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VWCEQ96DN2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
VWCEQ96DN2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
VWCEQ96DN2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VWCEQ96DN2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VWCEQ96DN2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VWCEQ96DN2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VWCEQ96DN2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VWCEQ96DN2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VWCEQ96DN2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VWCEQ96DN2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VWCEQ96DN2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VWCEQ96DN2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VWCEQ96DN2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VWCEQ96DN2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VWCEQ96DN2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VWCEQ96DN2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VWCEQ96DN2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
VWCEQ96DN2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VWCEQ96DN2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VWCEQ96DN2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VWCEQ96DN2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VWCEQ96DN2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VWCEQ96DN2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VWCEQ96DN2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VWCEQ96DN2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VWCEQ96DN2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VWCEQ96DN2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
VWCEQ96DN2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VWCEQ96DN2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VWCEQ96DN2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VWCEQ96DN2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VWCEQ96DN2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
VWCEQ96DN2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VWCEQ96DN2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VWCEQ96DN2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VWCEQ96DN2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VWCEQ96DN2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VWCEQ96DN2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VWCEQ96DN2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VWCEQ96DN2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VWCEQ96DN2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VWCEQ96DN2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VWCEQ96DN2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VWCEQ96DN2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VWCEQ96DN2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VWCEQ96DN2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
VWCEQ96DN2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VWCEQ96DN2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
VWCEQ96DN2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VWCEQ96DN2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VWCEQ96DN2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VWCEQ96DN2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VWCEQ96DN2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VWCEQ96DN2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VWCEQ96DN2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VWCEQ96DN2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VWCEQ96DN2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
VWCEQ96DN2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
VWCEQ96DN2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VWCEQ96DN2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VWCEQ96DN2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms