Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SYTL4Q96C24 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
SYTL4Q96C24 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SYTL4Q96C24 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SYTL4Q96C24 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SYTL4Q96C24 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SYTL4Q96C24 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SYTL4Q96C24 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
SYTL4Q96C24 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SYTL4Q96C24 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SYTL4Q96C24 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SYTL4Q96C24 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SYTL4Q96C24 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SYTL4Q96C24 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SYTL4Q96C24 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SYTL4Q96C24 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SYTL4Q96C24 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SYTL4Q96C24 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SYTL4Q96C24 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SYTL4Q96C24 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SYTL4Q96C24 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SYTL4Q96C24 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SYTL4Q96C24 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SYTL4Q96C24 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SYTL4Q96C24 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
SYTL4Q96C24 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SYTL4Q96C24 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SYTL4Q96C24 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SYTL4Q96C24 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SYTL4Q96C24 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SYTL4Q96C24 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
SYTL4Q96C24 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SYTL4Q96C24 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SYTL4Q96C24 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SYTL4Q96C24 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SYTL4Q96C24 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
SYTL4Q96C24 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SYTL4Q96C24 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SYTL4Q96C24 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SYTL4Q96C24 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SYTL4Q96C24 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SYTL4Q96C24 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SYTL4Q96C24 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SYTL4Q96C24 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SYTL4Q96C24 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SYTL4Q96C24 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SYTL4Q96C24 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SYTL4Q96C24 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SYTL4Q96C24 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SYTL4Q96C24 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SYTL4Q96C24 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SYTL4Q96C24 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SYTL4Q96C24 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SYTL4Q96C24 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SYTL4Q96C24 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SYTL4Q96C24 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SYTL4Q96C24 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SYTL4Q96C24 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SYTL4Q96C24 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SYTL4Q96C24 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SYTL4Q96C24 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SYTL4Q96C24 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SYTL4Q96C24 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
SYTL4Q96C24 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SYTL4Q96C24 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SYTL4Q96C24 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SYTL4Q96C24 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SYTL4Q96C24 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SYTL4Q96C24 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SYTL4Q96C24 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SYTL4Q96C24 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SYTL4Q96C24 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SYTL4Q96C24 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SYTL4Q96C24 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SYTL4Q96C24 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SYTL4Q96C24 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SYTL4Q96C24 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
SYTL4Q96C24 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SYTL4Q96C24 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
SYTL4Q96C24 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SYTL4Q96C24 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SYTL4Q96C24 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SYTL4Q96C24 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SYTL4Q96C24 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SYTL4Q96C24 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SYTL4Q96C24 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SYTL4Q96C24 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
SYTL4Q96C24 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SYTL4Q96C24 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SYTL4Q96C24 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SYTL4Q96C24 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SYTL4Q96C24 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SYTL4Q96C24 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SYTL4Q96C24 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SYTL4Q96C24 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SYTL4Q96C24 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SYTL4Q96C24 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SYTL4Q96C24 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SYTL4Q96C24 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SYTL4Q96C24 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms