Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC8Q96B26 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms