Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EME1Q96AY2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EME1Q96AY2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EME1Q96AY2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EME1Q96AY2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EME1Q96AY2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EME1Q96AY2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EME1Q96AY2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EME1Q96AY2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EME1Q96AY2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
EME1Q96AY2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EME1Q96AY2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EME1Q96AY2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EME1Q96AY2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EME1Q96AY2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms