Protein–RNA interactions for Protein: Q96A58

RERG, Ras-related and estrogen-regulated growth inhibitor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RERGQ96A58 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RERGQ96A58 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RERGQ96A58 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RERGQ96A58 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RERGQ96A58 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RERGQ96A58 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RERGQ96A58 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RERGQ96A58 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RERGQ96A58 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RERGQ96A58 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RERGQ96A58 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RERGQ96A58 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RERGQ96A58 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RERGQ96A58 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RERGQ96A58 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RERGQ96A58 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RERGQ96A58 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RERGQ96A58 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RERGQ96A58 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RERGQ96A58 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RERGQ96A58 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RERGQ96A58 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RERGQ96A58 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RERGQ96A58 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RERGQ96A58 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RERGQ96A58 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RERGQ96A58 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RERGQ96A58 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RERGQ96A58 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RERGQ96A58 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RERGQ96A58 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RERGQ96A58 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RERGQ96A58 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RERGQ96A58 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RERGQ96A58 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RERGQ96A58 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RERGQ96A58 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RERGQ96A58 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RERGQ96A58 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RERGQ96A58 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms