Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SNX21Q969T3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNX21Q969T3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNX21Q969T3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNX21Q969T3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SNX21Q969T3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNX21Q969T3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNX21Q969T3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNX21Q969T3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNX21Q969T3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNX21Q969T3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNX21Q969T3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNX21Q969T3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNX21Q969T3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNX21Q969T3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNX21Q969T3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNX21Q969T3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNX21Q969T3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNX21Q969T3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNX21Q969T3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNX21Q969T3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNX21Q969T3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNX21Q969T3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNX21Q969T3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNX21Q969T3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNX21Q969T3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNX21Q969T3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNX21Q969T3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNX21Q969T3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNX21Q969T3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNX21Q969T3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNX21Q969T3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SNX21Q969T3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNX21Q969T3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNX21Q969T3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNX21Q969T3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNX21Q969T3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNX21Q969T3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNX21Q969T3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNX21Q969T3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNX21Q969T3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNX21Q969T3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNX21Q969T3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNX21Q969T3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNX21Q969T3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SNX21Q969T3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNX21Q969T3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNX21Q969T3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNX21Q969T3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNX21Q969T3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNX21Q969T3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNX21Q969T3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNX21Q969T3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNX21Q969T3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNX21Q969T3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNX21Q969T3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNX21Q969T3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNX21Q969T3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNX21Q969T3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNX21Q969T3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNX21Q969T3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNX21Q969T3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNX21Q969T3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNX21Q969T3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNX21Q969T3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SNX21Q969T3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SNX21Q969T3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SNX21Q969T3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SNX21Q969T3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SNX21Q969T3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SNX21Q969T3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SNX21Q969T3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SNX21Q969T3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SNX21Q969T3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SNX21Q969T3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SNX21Q969T3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SNX21Q969T3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNX21Q969T3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNX21Q969T3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNX21Q969T3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNX21Q969T3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNX21Q969T3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNX21Q969T3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNX21Q969T3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNX21Q969T3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNX21Q969T3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNX21Q969T3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNX21Q969T3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNX21Q969T3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNX21Q969T3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SNX21Q969T3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNX21Q969T3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNX21Q969T3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNX21Q969T3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNX21Q969T3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNX21Q969T3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNX21Q969T3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNX21Q969T3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNX21Q969T3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNX21Q969T3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.6 ms