Protein–RNA interactions for Protein: Q969G2

LHX4, LIM/homeobox protein Lhx4, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX4Q969G2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LHX4Q969G2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LHX4Q969G2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LHX4Q969G2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LHX4Q969G2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LHX4Q969G2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LHX4Q969G2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LHX4Q969G2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LHX4Q969G2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LHX4Q969G2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LHX4Q969G2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LHX4Q969G2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LHX4Q969G2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LHX4Q969G2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LHX4Q969G2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LHX4Q969G2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LHX4Q969G2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LHX4Q969G2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
LHX4Q969G2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
LHX4Q969G2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LHX4Q969G2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LHX4Q969G2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LHX4Q969G2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LHX4Q969G2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LHX4Q969G2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LHX4Q969G2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LHX4Q969G2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LHX4Q969G2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LHX4Q969G2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LHX4Q969G2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LHX4Q969G2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LHX4Q969G2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
LHX4Q969G2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LHX4Q969G2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LHX4Q969G2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LHX4Q969G2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LHX4Q969G2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LHX4Q969G2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LHX4Q969G2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LHX4Q969G2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LHX4Q969G2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LHX4Q969G2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LHX4Q969G2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LHX4Q969G2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LHX4Q969G2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LHX4Q969G2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LHX4Q969G2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LHX4Q969G2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LHX4Q969G2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms