Protein–RNA interactions for Protein: Q969E4

TCEAL3, Transcription elongation factor A protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEAL3Q969E4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCEAL3Q969E4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCEAL3Q969E4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCEAL3Q969E4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCEAL3Q969E4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCEAL3Q969E4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TCEAL3Q969E4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCEAL3Q969E4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCEAL3Q969E4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCEAL3Q969E4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCEAL3Q969E4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCEAL3Q969E4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCEAL3Q969E4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCEAL3Q969E4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TCEAL3Q969E4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TCEAL3Q969E4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TCEAL3Q969E4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCEAL3Q969E4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCEAL3Q969E4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCEAL3Q969E4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCEAL3Q969E4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCEAL3Q969E4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCEAL3Q969E4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCEAL3Q969E4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCEAL3Q969E4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCEAL3Q969E4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCEAL3Q969E4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCEAL3Q969E4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCEAL3Q969E4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCEAL3Q969E4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCEAL3Q969E4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCEAL3Q969E4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCEAL3Q969E4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCEAL3Q969E4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TCEAL3Q969E4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCEAL3Q969E4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCEAL3Q969E4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCEAL3Q969E4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCEAL3Q969E4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCEAL3Q969E4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCEAL3Q969E4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCEAL3Q969E4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCEAL3Q969E4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCEAL3Q969E4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCEAL3Q969E4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCEAL3Q969E4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TCEAL3Q969E4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCEAL3Q969E4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCEAL3Q969E4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCEAL3Q969E4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCEAL3Q969E4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCEAL3Q969E4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCEAL3Q969E4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCEAL3Q969E4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCEAL3Q969E4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCEAL3Q969E4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCEAL3Q969E4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TCEAL3Q969E4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TCEAL3Q969E4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TCEAL3Q969E4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TCEAL3Q969E4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCEAL3Q969E4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCEAL3Q969E4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCEAL3Q969E4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCEAL3Q969E4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCEAL3Q969E4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCEAL3Q969E4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TCEAL3Q969E4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCEAL3Q969E4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCEAL3Q969E4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCEAL3Q969E4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TCEAL3Q969E4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCEAL3Q969E4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCEAL3Q969E4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCEAL3Q969E4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCEAL3Q969E4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCEAL3Q969E4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCEAL3Q969E4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCEAL3Q969E4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TCEAL3Q969E4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCEAL3Q969E4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCEAL3Q969E4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCEAL3Q969E4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCEAL3Q969E4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCEAL3Q969E4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TCEAL3Q969E4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCEAL3Q969E4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCEAL3Q969E4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCEAL3Q969E4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCEAL3Q969E4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCEAL3Q969E4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCEAL3Q969E4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCEAL3Q969E4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCEAL3Q969E4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCEAL3Q969E4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCEAL3Q969E4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCEAL3Q969E4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCEAL3Q969E4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCEAL3Q969E4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCEAL3Q969E4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms