Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BHMTQ93088 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BHMTQ93088 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BHMTQ93088 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BHMTQ93088 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BHMTQ93088 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BHMTQ93088 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BHMTQ93088 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BHMTQ93088 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BHMTQ93088 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BHMTQ93088 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BHMTQ93088 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BHMTQ93088 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BHMTQ93088 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BHMTQ93088 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BHMTQ93088 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BHMTQ93088 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BHMTQ93088 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BHMTQ93088 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BHMTQ93088 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BHMTQ93088 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BHMTQ93088 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BHMTQ93088 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BHMTQ93088 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BHMTQ93088 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BHMTQ93088 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BHMTQ93088 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BHMTQ93088 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BHMTQ93088 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BHMTQ93088 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BHMTQ93088 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BHMTQ93088 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BHMTQ93088 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BHMTQ93088 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
BHMTQ93088 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
BHMTQ93088 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BHMTQ93088 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BHMTQ93088 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BHMTQ93088 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BHMTQ93088 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BHMTQ93088 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BHMTQ93088 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BHMTQ93088 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BHMTQ93088 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BHMTQ93088 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BHMTQ93088 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BHMTQ93088 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BHMTQ93088 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BHMTQ93088 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BHMTQ93088 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BHMTQ93088 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BHMTQ93088 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BHMTQ93088 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BHMTQ93088 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BHMTQ93088 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BHMTQ93088 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BHMTQ93088 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BHMTQ93088 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BHMTQ93088 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BHMTQ93088 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BHMTQ93088 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BHMTQ93088 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BHMTQ93088 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BHMTQ93088 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BHMTQ93088 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BHMTQ93088 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BHMTQ93088 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BHMTQ93088 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BHMTQ93088 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BHMTQ93088 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BHMTQ93088 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BHMTQ93088 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BHMTQ93088 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BHMTQ93088 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BHMTQ93088 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BHMTQ93088 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BHMTQ93088 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BHMTQ93088 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BHMTQ93088 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
BHMTQ93088 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BHMTQ93088 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BHMTQ93088 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BHMTQ93088 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BHMTQ93088 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BHMTQ93088 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BHMTQ93088 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BHMTQ93088 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BHMTQ93088 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BHMTQ93088 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BHMTQ93088 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BHMTQ93088 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BHMTQ93088 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BHMTQ93088 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BHMTQ93088 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BHMTQ93088 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BHMTQ93088 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BHMTQ93088 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BHMTQ93088 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BHMTQ93088 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BHMTQ93088 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms