Protein–RNA interactions for Protein: Q92925

SMARCD2, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD2Q92925 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCD2Q92925 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCD2Q92925 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCD2Q92925 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCD2Q92925 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCD2Q92925 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCD2Q92925 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCD2Q92925 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCD2Q92925 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCD2Q92925 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCD2Q92925 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCD2Q92925 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCD2Q92925 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCD2Q92925 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCD2Q92925 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCD2Q92925 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCD2Q92925 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCD2Q92925 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCD2Q92925 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCD2Q92925 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCD2Q92925 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCD2Q92925 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCD2Q92925 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCD2Q92925 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCD2Q92925 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCD2Q92925 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCD2Q92925 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCD2Q92925 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCD2Q92925 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCD2Q92925 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMARCD2Q92925 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMARCD2Q92925 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCD2Q92925 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCD2Q92925 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCD2Q92925 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCD2Q92925 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCD2Q92925 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCD2Q92925 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCD2Q92925 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCD2Q92925 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCD2Q92925 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCD2Q92925 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCD2Q92925 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCD2Q92925 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCD2Q92925 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCD2Q92925 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCD2Q92925 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCD2Q92925 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCD2Q92925 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCD2Q92925 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCD2Q92925 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCD2Q92925 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCD2Q92925 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCD2Q92925 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCD2Q92925 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCD2Q92925 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCD2Q92925 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCD2Q92925 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCD2Q92925 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCD2Q92925 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCD2Q92925 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCD2Q92925 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCD2Q92925 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCD2Q92925 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCD2Q92925 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCD2Q92925 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMARCD2Q92925 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCD2Q92925 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCD2Q92925 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCD2Q92925 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCD2Q92925 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCD2Q92925 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCD2Q92925 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCD2Q92925 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCD2Q92925 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCD2Q92925 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCD2Q92925 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCD2Q92925 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCD2Q92925 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCD2Q92925 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCD2Q92925 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCD2Q92925 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCD2Q92925 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCD2Q92925 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCD2Q92925 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCD2Q92925 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCD2Q92925 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCD2Q92925 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCD2Q92925 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCD2Q92925 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCD2Q92925 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCD2Q92925 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCD2Q92925 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCD2Q92925 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCD2Q92925 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCD2Q92925 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCD2Q92925 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCD2Q92925 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCD2Q92925 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCD2Q92925 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms