Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GATA6Q92908 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GATA6Q92908 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GATA6Q92908 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GATA6Q92908 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GATA6Q92908 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GATA6Q92908 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GATA6Q92908 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GATA6Q92908 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GATA6Q92908 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GATA6Q92908 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GATA6Q92908 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GATA6Q92908 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GATA6Q92908 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GATA6Q92908 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GATA6Q92908 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GATA6Q92908 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GATA6Q92908 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GATA6Q92908 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GATA6Q92908 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GATA6Q92908 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GATA6Q92908 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GATA6Q92908 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GATA6Q92908 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GATA6Q92908 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GATA6Q92908 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GATA6Q92908 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GATA6Q92908 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GATA6Q92908 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GATA6Q92908 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GATA6Q92908 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GATA6Q92908 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GATA6Q92908 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GATA6Q92908 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GATA6Q92908 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GATA6Q92908 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GATA6Q92908 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GATA6Q92908 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GATA6Q92908 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GATA6Q92908 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GATA6Q92908 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GATA6Q92908 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GATA6Q92908 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GATA6Q92908 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GATA6Q92908 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GATA6Q92908 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GATA6Q92908 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GATA6Q92908 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GATA6Q92908 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GATA6Q92908 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GATA6Q92908 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GATA6Q92908 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GATA6Q92908 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GATA6Q92908 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GATA6Q92908 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GATA6Q92908 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GATA6Q92908 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GATA6Q92908 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GATA6Q92908 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GATA6Q92908 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GATA6Q92908 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GATA6Q92908 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GATA6Q92908 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GATA6Q92908 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GATA6Q92908 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GATA6Q92908 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GATA6Q92908 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GATA6Q92908 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GATA6Q92908 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GATA6Q92908 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GATA6Q92908 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GATA6Q92908 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GATA6Q92908 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GATA6Q92908 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GATA6Q92908 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GATA6Q92908 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GATA6Q92908 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GATA6Q92908 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GATA6Q92908 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GATA6Q92908 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GATA6Q92908 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GATA6Q92908 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GATA6Q92908 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GATA6Q92908 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GATA6Q92908 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GATA6Q92908 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GATA6Q92908 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GATA6Q92908 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GATA6Q92908 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GATA6Q92908 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GATA6Q92908 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GATA6Q92908 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GATA6Q92908 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GATA6Q92908 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GATA6Q92908 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GATA6Q92908 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GATA6Q92908 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GATA6Q92908 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GATA6Q92908 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GATA6Q92908 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms