Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RAD50Q92878 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RAD50Q92878 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RAD50Q92878 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RAD50Q92878 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RAD50Q92878 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RAD50Q92878 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RAD50Q92878 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RAD50Q92878 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
RAD50Q92878 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RAD50Q92878 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RAD50Q92878 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RAD50Q92878 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RAD50Q92878 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RAD50Q92878 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RAD50Q92878 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RAD50Q92878 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RAD50Q92878 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RAD50Q92878 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RAD50Q92878 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
RAD50Q92878 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RAD50Q92878 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RAD50Q92878 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RAD50Q92878 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RAD50Q92878 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RAD50Q92878 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RAD50Q92878 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RAD50Q92878 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RAD50Q92878 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RAD50Q92878 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAD50Q92878 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RAD50Q92878 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAD50Q92878 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAD50Q92878 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAD50Q92878 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAD50Q92878 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RAD50Q92878 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAD50Q92878 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAD50Q92878 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RAD50Q92878 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RAD50Q92878 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RAD50Q92878 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RAD50Q92878 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RAD50Q92878 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAD50Q92878 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAD50Q92878 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAD50Q92878 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAD50Q92878 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAD50Q92878 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAD50Q92878 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RAD50Q92878 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAD50Q92878 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAD50Q92878 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAD50Q92878 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RAD50Q92878 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAD50Q92878 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAD50Q92878 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAD50Q92878 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAD50Q92878 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAD50Q92878 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAD50Q92878 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAD50Q92878 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAD50Q92878 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAD50Q92878 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAD50Q92878 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAD50Q92878 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAD50Q92878 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAD50Q92878 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RAD50Q92878 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAD50Q92878 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAD50Q92878 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RAD50Q92878 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RAD50Q92878 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RAD50Q92878 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
RAD50Q92878 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
RAD50Q92878 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAD50Q92878 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAD50Q92878 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAD50Q92878 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAD50Q92878 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAD50Q92878 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAD50Q92878 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAD50Q92878 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAD50Q92878 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAD50Q92878 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAD50Q92878 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAD50Q92878 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAD50Q92878 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAD50Q92878 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAD50Q92878 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAD50Q92878 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAD50Q92878 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAD50Q92878 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAD50Q92878 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAD50Q92878 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RAD50Q92878 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAD50Q92878 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAD50Q92878 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAD50Q92878 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAD50Q92878 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms