Protein–RNA interactions for Protein: Q92753

RORB, Nuclear receptor ROR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORBQ92753 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RORBQ92753 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RORBQ92753 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RORBQ92753 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RORBQ92753 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RORBQ92753 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RORBQ92753 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RORBQ92753 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RORBQ92753 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RORBQ92753 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RORBQ92753 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RORBQ92753 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RORBQ92753 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RORBQ92753 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RORBQ92753 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RORBQ92753 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RORBQ92753 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RORBQ92753 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RORBQ92753 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RORBQ92753 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RORBQ92753 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RORBQ92753 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RORBQ92753 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RORBQ92753 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RORBQ92753 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RORBQ92753 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RORBQ92753 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RORBQ92753 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RORBQ92753 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RORBQ92753 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RORBQ92753 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RORBQ92753 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RORBQ92753 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RORBQ92753 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RORBQ92753 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RORBQ92753 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RORBQ92753 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RORBQ92753 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RORBQ92753 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RORBQ92753 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RORBQ92753 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RORBQ92753 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RORBQ92753 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RORBQ92753 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RORBQ92753 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RORBQ92753 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RORBQ92753 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RORBQ92753 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RORBQ92753 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RORBQ92753 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RORBQ92753 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RORBQ92753 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RORBQ92753 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RORBQ92753 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RORBQ92753 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RORBQ92753 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RORBQ92753 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RORBQ92753 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RORBQ92753 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RORBQ92753 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RORBQ92753 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RORBQ92753 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RORBQ92753 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RORBQ92753 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RORBQ92753 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RORBQ92753 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RORBQ92753 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RORBQ92753 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RORBQ92753 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RORBQ92753 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RORBQ92753 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RORBQ92753 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RORBQ92753 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RORBQ92753 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RORBQ92753 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RORBQ92753 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RORBQ92753 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RORBQ92753 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RORBQ92753 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RORBQ92753 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RORBQ92753 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RORBQ92753 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RORBQ92753 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RORBQ92753 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RORBQ92753 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
RORBQ92753 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RORBQ92753 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RORBQ92753 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RORBQ92753 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RORBQ92753 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RORBQ92753 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RORBQ92753 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RORBQ92753 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RORBQ92753 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RORBQ92753 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RORBQ92753 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RORBQ92753 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RORBQ92753 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RORBQ92753 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RORBQ92753 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms