Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3AQ92664 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3AQ92664 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3AQ92664 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3AQ92664 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3AQ92664 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3AQ92664 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3AQ92664 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3AQ92664 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3AQ92664 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3AQ92664 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3AQ92664 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3AQ92664 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3AQ92664 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3AQ92664 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3AQ92664 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3AQ92664 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3AQ92664 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3AQ92664 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3AQ92664 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3AQ92664 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3AQ92664 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3AQ92664 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF3AQ92664 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF3AQ92664 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF3AQ92664 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GTF3AQ92664 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GTF3AQ92664 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GTF3AQ92664 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GTF3AQ92664 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GTF3AQ92664 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF3AQ92664 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF3AQ92664 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF3AQ92664 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF3AQ92664 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF3AQ92664 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF3AQ92664 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF3AQ92664 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF3AQ92664 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF3AQ92664 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF3AQ92664 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF3AQ92664 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF3AQ92664 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF3AQ92664 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF3AQ92664 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.1 ms