Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBXN4Q92575 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBXN4Q92575 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBXN4Q92575 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBXN4Q92575 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBXN4Q92575 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBXN4Q92575 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBXN4Q92575 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBXN4Q92575 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBXN4Q92575 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBXN4Q92575 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBXN4Q92575 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBXN4Q92575 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBXN4Q92575 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBXN4Q92575 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBXN4Q92575 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBXN4Q92575 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBXN4Q92575 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBXN4Q92575 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBXN4Q92575 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBXN4Q92575 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBXN4Q92575 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBXN4Q92575 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBXN4Q92575 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBXN4Q92575 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBXN4Q92575 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
UBXN4Q92575 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBXN4Q92575 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBXN4Q92575 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBXN4Q92575 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBXN4Q92575 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBXN4Q92575 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBXN4Q92575 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBXN4Q92575 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBXN4Q92575 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBXN4Q92575 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBXN4Q92575 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBXN4Q92575 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBXN4Q92575 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBXN4Q92575 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBXN4Q92575 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBXN4Q92575 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
UBXN4Q92575 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBXN4Q92575 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBXN4Q92575 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBXN4Q92575 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBXN4Q92575 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBXN4Q92575 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBXN4Q92575 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBXN4Q92575 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBXN4Q92575 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBXN4Q92575 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBXN4Q92575 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBXN4Q92575 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBXN4Q92575 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBXN4Q92575 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBXN4Q92575 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
UBXN4Q92575 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBXN4Q92575 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBXN4Q92575 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBXN4Q92575 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBXN4Q92575 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBXN4Q92575 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBXN4Q92575 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBXN4Q92575 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBXN4Q92575 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBXN4Q92575 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBXN4Q92575 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBXN4Q92575 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBXN4Q92575 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBXN4Q92575 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBXN4Q92575 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBXN4Q92575 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBXN4Q92575 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
UBXN4Q92575 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBXN4Q92575 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBXN4Q92575 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBXN4Q92575 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBXN4Q92575 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBXN4Q92575 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBXN4Q92575 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBXN4Q92575 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBXN4Q92575 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBXN4Q92575 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBXN4Q92575 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBXN4Q92575 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBXN4Q92575 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBXN4Q92575 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBXN4Q92575 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBXN4Q92575 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBXN4Q92575 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBXN4Q92575 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN4Q92575 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN4Q92575 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN4Q92575 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN4Q92575 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN4Q92575 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN4Q92575 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN4Q92575 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN4Q92575 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms